衣娜
- 作品数：6 被引量：2H指数：1
- 供职机构：上海大学理学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金上海市教育委员会重点学科基金国家科技重大专项更多>>
- 相关领域：理学自动化与计算机技术生物学医药卫生更多>>
- 时滞生化反应系统的随机模拟算法研究
- 细胞内的生命活动是一个非常复杂的过程,包含了成千上万个相互作用的网络,因此对这些相互作用网络进行建模和仿真是研究生命现象的一个重要的课题.而细胞内的生命活动又是一个随时空演化的动态过程,细胞内化学反应的随机性,细胞中某些...
- 衣娜
- 关键词：生化反应系统随机模拟算法
- 基于提升小波的基因芯片数据的分类预测
- 2014年
- 针对肿瘤的早期诊断,提出了一种基于提升小波变换的特征提取的方法,对肿瘤数据样本进行分析鉴别.该方法利用提升小波变换对190例肝癌(包括对照)和107例肺癌(包括对照)基因表达谱芯片数据进行处理后,提取信号的低频信息,经支持向量机训练学习,构造分类器模型,用于癌和非癌样本的区分甄别.实验结果表明,经提升小波变换提取的特征基因,送入分类器中能得到较高的分类率,且在支持向量机中选取线性核函数或径向基函数都能达到较好的分类效果.通过随机选取的20例基因表改谱芯片样本,对所建立的模型进行了测试,获得了很好的效果,因此,本文提出的方法对肿瘤的诊断有一定的应用意义.
- 凌玲衣娜王翼飞
- 关键词：提升小波支持向量机核函数
- 三阶隐马氏模型算法及其与一阶隐马氏模型的关系被引量：2
- 2011年
- 为了考虑更多的统计特征,提出了一类三阶隐马氏模型,其中状态转移和输出观测同时取决于当前状态和前面两个状态.研究和推导了这类三阶隐马氏模型中估值问题的向前—向后算法、解码问题的Viterbi算法和学习问题的Baum-Welch算法.对此类三阶隐马氏模型,构造了一个与之等价的一阶隐马氏模型,提出并证明了它们的等价性定理.研究结果丰富了隐马氏模型的算法理论,可为一些实际应用提供更好的方法.
- 叶飞衣娜王翼飞
- 关键词：VITERBI算法
- 生化反应系统的加速τ-Leap模拟算法
- 2011年
- 该文重新定义了临界反应,以更合理地界定可能出现负分子组分的反应.在此基础上提出了加速τ-leap算法,使系统中某些反应物数目较少时也可以采用τ-leap方法进行模拟,同时提高了模拟速度.以两个生化反应系统模型为例,分别用精确的随机模拟算法、修正τ-leap算法和加速τ-leap算法进行模拟运算,结果表明加速τ-leap算法在保证精度的同时能有效提高模拟速度.
- 衣娜庄刚王翼飞
- 关键词：随机模拟算法生化反应系统
- 多重时滞生化反应系统的MD-Leaping算法
- 2013年
- 针对多重时滞生化反应系统,提出MD-Leaping模拟算法,该算法能快速有效地刻画封闭系统中生化反应的进程和结果.相较于D-Leaping算法,针对单时滞反应建立以反应序列为主体的四元结构体,该算法通过对多重时滞反应系统建立以不同时滞时间为主体的四元结构体,使得在每一个跳跃时间步长内可以同时模拟多个生化反应,提高了模拟速度.该算法拓展D-Ieaping算法,并首次解决多重时滞生化反应系统的加速模拟问题.通过对2个具体生化反应系统的模拟表明,该算法可以广泛地应用于多重时滞生化反应系统,并且与已有的多重时滞系统非跳跃方法(multi-delay stochasticsimulation algorithm,MDSSA)相比,其运行效率有显著提高.
- 庄刚衣娜答亮王翼飞
- 关键词：随机模拟算法生化反应系统
