闫蓬勃
- 作品数：4 被引量：5H指数：1
- 供职机构：河北大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家科技重大专项教育部留学回国人员科研启动基金更多>>
- 相关领域：生物学自动化与计算机技术农业科学更多>>
- 蛋白质二级结构定义服务器DSSP和STRIDE的比较与应用
- 2008年
- 为了便于快速了解蛋白质的结构特征,解析已经通过X-射线衍射或者由核磁共振测定的蛋白质的二级结构,一些定义蛋白质二级结构的系统被建立起来。蛋白质二级结构定义软件DSSP和STRIDE都是旨在说明这些已测定的蛋白质原子坐标的软件,它们根据原子坐标将蛋白质残基划分为不同的二级结构,对于了解蛋白质的空间结构做了很大的贡献。本文对两者进行了深入的比较和分析,总结出DSSP和STRIDE的应用条件及各自的利弊得失。
- 闫蓬勃刘建国刘明姚依昆
- 关键词：蛋白质二级结构
- 基于进化信息改进蛋白质定点突变稳定性预测准确率被引量：1
- 2009年
- 定点突变后蛋白质稳定性的增加还是降低,是分子生物学和蛋白质工程的核心问题之一,也是目前生物信息学研究的重要领域。基于蛋白质序列信息对蛋白质定点突变后的稳定性进行预测的方法,因其简易、适用面广而得到广泛的研究应用。通过对编码策略(coding schemes)的探索,发现不同编码策略对预测准确率有较大影响,并发现基于进化信息的BLOSUM打分矩阵可以用于蛋白质定点突变稳定性预测,具有较高的预测准确率。应用基于BLOSUM62打分矩阵的神经网络(ANN)和支持向量机(SVM)算法,可以改进蛋白质定点突变后稳定性的预测,而且ANN+BLOSUM62在1623条序列的数据集上的实测结果优于目前国际通用的几款预测软件。
- 刘建国刘建荣刘明闫蓬勃
- 关键词：定点突变神经网络SVM
- 蛋白质二级结构预测准确率影响因素探讨
- 从蛋白质的一级序列得到其对应的三维结构是目前生物信息学领域重要的课题之一。计算机预测方法被广泛应用于蛋白质二级结构的研究，其发展过程大体分为两个阶段：第一个阶段以数理统计作为出发点，基于单个氨基酸信息，如Chou-Fas...
- 闫蓬勃
- 关键词：蛋白质二级结构预测
- 文献传递
- 白洋淀湿地芦苇生长参数的线性分析被引量：4
- 2010年
- 在野外实地调查的基础上,从白洋淀湿地芦苇生长参数角度对试验数据进行了整理并对其进行相关分析。结果表明,株高与叶片鲜重、株高与茎鲜重、直径与叶片鲜重、叶片鲜重与茎鲜重呈显著正相关,其余组别的数据呈正相关。对4组呈显著正相关的参数用线性函数进行了定量模型拟合,为该地芦苇的生理生化及功能方面的进一步研究打下了一定的基础。
- 李博刘存歧闫蓬勃王军霞张亚娟田志富
- 关键词：芦苇
