高欢欢
- 作品数：7 被引量：32H指数：2
- 供职机构：湖北中医药大学药学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金长江学者和创新团队发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：医药卫生农业科学生物学更多>>
- 菊属植物DNA分子鉴定研究进展被引量：2
- 2014年
- 本文对以药用植物菊和野菊为代表的菊属植物DNA分子鉴定研究现状进行了整理和归纳,对基因组原位杂交、DNA分子标记以及DNA条形码等代表性的DNA分子鉴定技术在菊属植物中的研究进行了总结、讨论和展望,为菊属植物的分类鉴定和整理交流提供了科学依据。
- 胡志刚夏叶郑贝胡志强高欢欢刘合刚
- 关键词：菊属
- 濒危药用植物麻花秦艽和粗茎秦艽cpDNA提取研究
- 2013年
- 目的：对麻花秦艽和粗茎秦艽叶绿体基因组进行提取研究，为进一步研究秦艽叶绿体的基因组序列特征、遗传多样性以及资源保护研究奠定基础。方法：本文以麻花秦艽、粗茎秦艽为对象，采用改良的蔗糖密度梯度离心方法进行提取，优化纯化方法，分离得到秦艽叶绿体后测定cpDNA浓度，检测其OD值并扩增ITS2序列验证其纯度。结果：获得高质量、高纯度的cpDNA（0．1～0．4μg／10g），扩增ITS2序列验证其无核污染，满足后续测序要求。结论：cpDNA的纯度和质量对叶绿体基因组测序的正确率和可信度具有重要的影响。本文获得了高纯度、高质量的秦艽cpDNA，为秦艽叶绿体基因组全序列的获得提供保障。
- 高欢欢倪梁红胡志刚姚辉吴和珍潘宏林
- 关键词：麻花秦艽叶绿体DNA
- 基于454FLX高通量技术的厚朴叶绿体全基因组测序及应用研究被引量：26
- 2012年
- 叶绿体基因组序列在中药DNA条形码鉴定及基因工程生物制药方面具有广泛的应用前景。本文应用454高通量测序技术对厚朴进行了叶绿体全基因组测序,建立了标准测序流程。生物信息学分析共获得有效序列重叠群(contig)14个,测序覆盖度达到99.99%。厚朴叶绿体基因组大小为160 183 bp,大(LSC)、小(SSC)单拷贝区大小分别为88 210 bp和18 843 bp,反向互补重复区(IR)大小为26 565 bp,共注释叶绿体基因126个,其中每个IR区17个。厚朴与木兰亚纲其他物种的叶绿体编码基因在种类、排列顺序及结构大小上基本一致。采用叶绿体81个蛋白编码基因对厚朴及同属5个种9个样本进行了分子鉴定,鉴定效率100%,并且可以成功区分不同产地的凹叶厚朴。以上结果表明,本研究建立的标准测序流程适用于叶绿体基因组测序,叶绿体基因组序列可有效区分厚朴及近缘物种。
- 李西文胡志刚林小涵李卿高欢欢罗国安陈士林
- 关键词：厚朴DNA提取基因组比较焦磷酸测序
- 荷花玉兰叶绿体全基因组高通量测序及结构解析
- 荷花玉兰是重要的药用、观赏及园林绿化植物。本文应用454高通量测序技术对荷花玉兰叶绿体全基因组进行测序,解析了其基因组结构,并与近缘物种基因组进行了比较.荷花玉兰叶绿体基因组全长为159623 bp,两个反向互补重复区(...
- 李西文高欢欢宋经元吴和珍胡志刚姚辉罗红梅
- 关键词：叶绿体基因工程木兰科
- 文献传递
- 基于第二代高通量测序的荷花玉兰叶绿体全基因组研究
- 叶绿体是植物进行光合作用和能量转化的重要细胞器。叶绿体细胞内具有自主遗传信息，属于母系遗传。与核基因相比，叶绿体基因比核基因小，便于克隆与遗传操作;具有多拷贝，可高效表达目的基因;外源基因可以定点整合，无位置效应和基因沉...
- 高欢欢
- 关键词：叶绿体基因系统发育
- 文献传递
- 基于454FLX高通量技术的菊花叶绿体全基因组测序研究
- 叶绿体基因组在植物物种鉴定、DNA条形码筛选、系统进化分析以及叶绿体基因工程等领域应用前景广阔。本文应用454FLX高通量测序技术对菊花进行了叶绿体全基因组测序,并解析了其基因组结构。生物信息学分析表明,参与菊花序列拼接...
- 胡志刚李西文高欢欢林小涵李卿吴和珍
- 关键词：菊花叶绿体基因组注释焦磷酸测序
- 文献传递
- 荷花玉兰叶绿体全基因组高通量测序及结构解析被引量：7
- 2012年
- 荷花玉兰是重要的药用、观赏及园林绿化植物.应用454高通量测序技术对荷花玉兰叶绿体全基因组进行测序,解析了其基因组结构,并与近缘物种基因组进行了比较分析.荷花玉兰叶绿体基因组全长为159623bp,两个反向互补重复区(IRs)长26563bp,被分隔的大单拷贝区(LSC)和小单拷贝区(SSC)长度分别为87757和18740bp.成功注释129个叶绿体基因,其中18个基因含有内含子.基因的种类、数目以及GC含量等与其他木兰科物种相类似.生物信息学分析获得218个SSR位点,大多位点富含A-T,具有碱基偏好性.木兰科物种的重复基序类型和丰度相对保守,有利于开发叶绿体基因组载体.木兰亚纲植物叶绿体基因组的大小及IR区边界的变化与ycf1的长度密切相关.采用30个物种叶绿体基因组的66个共有蛋白编码基因构建系统发育树,对木兰属在被子植物中的进化位置进行了探讨.荷花玉兰叶绿体全基因组序列的获得和结构解析对优良品种培育、叶绿体基因组工程、木兰科物种分子标记开发及系统发育关系的研究具有重要价值.
- 李西支高欢欢王一涛宋经元Henry Robert吴和珍胡志刚姚辉罗红梅罗焜潘宏林陈士林
- 关键词：内含子系统进化
