李方廷
- 作品数：24 被引量：35H指数：3
- 供职机构：北京大学更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金国家重点基础研究发展计划更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生理学自然科学总论更多>>
- 芽殖酵母细胞分裂周期的动力学模型研究
- 对真核模式生物芽殖酵母的细胞分裂过程建立连续微分方程模型，以研究其全局动力学性质和检查点的控制机制。我们的模型基于已知的调控细胞周期各时相进行和转移的关键基因和蛋白的相互作用，旨在从系统层面探索细胞的这一基础过程的稳定性...
- 赵耀李方廷汤超
- 关键词：细胞周期动力系统鞍结分岔鲁棒性
- 芽殖酵母细胞周期过程不同时期的定量观测
- 2019年
- 在芽殖酵母中构建CDC10-mCherry和SPC42-mCherry荧光蛋白,作为酵母细胞周期不同时期的报告系统。根据酵母细胞中芽环(CDC10-mCherry)的产生和消失以及纺锤体极体(SPC42-mCherry)的复制和分离,可以测量细胞周期中G1期、S期、EarlyM期和LateM期的时间长度。在此报告系统的基础上,分别构建S期细胞周期蛋白CLB5-GFP和M期细胞周期蛋白CLB2-GFP菌株,实现单细胞观测,检验报告系统工作的稳定性和准确性。该报告系统可作为研究酵母细胞周期不同时期时间长度等定量生物学问题的背景菌株。
- 张志温李方廷
- 关键词：芽殖酵母细胞周期
- 再循环B淋巴细胞昼夜节律现象的数学模型被引量：1
- 2001年
- 根据免疫系统中参与再循环过程的B淋巴细胞昼夜节律现象的实验结果 ,提出皮质类激素作用于B淋巴细胞再循环过程的假设 ,建立了皮质类激素作用下的B细胞在骨髓、外周淋巴器官 (淋巴结、脾脏 )与血液之间再循环过程的数学模型 ,讨论了皮质类激素作用的强度及有关参量的取值范围及模型对参数的依赖性 .模型能够解释参与再循环的B细胞在骨髓、淋巴结、脾脏和血液中的稳定振荡行为 ,而且对皮质激素在骨髓与外周血中B细胞迁移过程中的作用进行了定量研究 .理论结果与实验结果基本一致 .
- 李方廷漆安慎
- 关键词：免疫系统昼夜节律皮质激素数学模型免疫应答
- 生物系统中的非线性现象
- 2007年
- 文章通过用非线性科学的基本概念与系统方法分析了芽殖酵母细胞周期网络的动力学行为,说明非线性科学在定量研究生命过程所可能起到的重要作用,同时说明非线性科学现有的分析手段在研究生命系统中的局限性.这样利用非线性动力学研究生物系统的动力学问题,不但可以为系统生物学的研究提供强大的数学工具,同时也可以推动非线性科学本身的发展.这项研究从另一个角度显示了交叉学科的生命力.
- 李方廷欧阳颀
- 关键词：非线性动力学芽殖酵母细胞周期
- Systematic genetic interaction mapping of cell-cycle process in both budding yeast and fission yeast
- The gene interactions govern the various biological processes and phenotype of biological organism.During the ...
- 李方廷邓明华欧阳颀汤超
- 文献传递
- 再循环T细胞昼夜节律现象的数学模型被引量：2
- 2001年
- 根据人体和小鼠免疫细胞昼夜节律实验结果 ,提出皮质类激素对淋巴结和脾脏中T细胞再循环产生不同作用的假设 ,建立了皮质类激素作用下的T细胞在不同外周淋巴器官 (淋巴结、脾脏 )与血液之间再循环过程的数学模型 ,讨论了皮质类激素作用的强度、有关参量的取值范围和模型对参数的依赖性 .模型能够解释参与再循环的T细胞在淋巴结、脾脏与血液中的稳定振荡行为 。
- 李方廷漆安慎
- 关键词：免疫细胞昼夜节律数学模型
- 酵母蛋白质网络的动力学性质被引量：2
- 2003年
- 蛋白质 -蛋白质、蛋白质 -DNA相互作用网络决定了细胞中各种关键功能的执行 .基于芽殖酵母 (bud dingyeastsaccharomycescerevisiae)的蛋白质 -蛋白质相互作用网络数据和相关的实验文献 ,我们建立了调控细胞周期和生命周期 (cellcycleandlifecycle)的蛋白质网络 ,并利用离散模型研究了该网络的动力学性质 .研究表明 :细胞周期网络的动力学性质具有很强的稳定性 ,约 94 %的蛋白质初态将演化到对应于生物学G1基态的稳定态 ,使其成为惟一的全局吸引点 ;同时 ,绝大多数的初态的演化路径都通过由G1激发态到G1基态的细胞周期演化路径 ,使细胞周期路径成为全局性的“吸引”
- 李方廷吕莹龙涛欧阳颀汤超
- 关键词：芽殖酵母细胞周期生物物理学
- 免疫效度或临床相对免疫效度在评价受试者的疫苗应答强度中的应用
- 本发明提供了免疫效度ε或临床相对免疫效度ε<Sup>*</Sup>在评价受试者的疫苗应答强度中的应用，属于生物医学技术领域。本发明从免疫学原理出发，综合考虑参与人体免疫反应的核心信号通路、淋巴细胞、细胞因子的体内循环，以...
- 李方廷李典杰李键玮周正清
- 酵母细胞周期过程的全局动力学稳定性:临界慢化、压缩流形与检验点
- 近年来的芽殖酵母定量生物学研究表明,细胞细胞周期过程中进入 DNA 复制期(S期)和G2/M期转化(第2 间期进入有丝分裂M期)等重要事件是由相应的遗传学开关控制的,而这些开关的动力学机理是调控网络中正反馈所引起鞍-结点...
- 李方廷
- 2型糖尿病发病过程中胰岛炎症的动力学机理被引量：15
- 2020年
- 2型糖尿病是一种以慢性高血糖为主要特征的代谢性疾病,其发病机制复杂.近年来的研究发现,糖脂代谢紊乱造成的慢性炎症可引起机体胰岛损伤,与2型糖尿病发生发展密切相关.但是,由代谢紊乱诱发的胰岛炎症如何发展并最终导致胰岛功能不可逆性损伤的机制尚未完全阐明.本研究,首先选取自发性2型糖尿病GK大鼠和转基因动物IDOL小鼠,建立了胰岛炎症实验模型并对相关炎症因子变化进行检测,结果显示巨噬细胞与胰岛炎症进程相关.随后建立相应的定量数学模型描述胰岛β细胞和巨噬细胞相互作用,理论模型的结果表明,胰岛β细胞和巨噬细胞之间的正反馈回路可能导致IL-1β的激活过程存在不可逆双稳态和磁滞回线效应,并导致胰岛炎症的不可逆性发展.本研究提出了胰岛炎症过程中动力学机理,希望能够为2型糖尿病发病机制的深入研究和治疗药物的研发提供新的思路和有益的帮助.
- 雷蕾林智立王琳琳赵德王友李方廷
- 关键词：2型糖尿病糖毒性脂毒性巨噬细胞浸润
