倪志华
- 作品数：47 被引量：190H指数：8
- 供职机构：河北大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金保定市科技局科学技术研究与发展指导计划项目河北省自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学医药卫生文化科学化学工程更多>>
- 兔脑组织因子基因的克隆与表达
- 倪志华
- 凝结芽孢杆菌中耐热木酮糖激酶基因的克隆表达及生信分析
- 2019年
- 该研究以凝结芽孢杆菌(Bacillus coagulans)IPE22为研究对象,通过聚合酶链式反应(PCR)扩增获得木酮糖激酶基因Bc-XK,将其与载体pET-30a连接后,在大肠杆菌(Escherichia coli)BL21(DE3)中进行诱导表达。然后采用镍柱亲和层析纯化重组酶Bc-XK,对基因Bc-XK及其编码的蛋白质进行生信分析。结果表明,纯化后重组酶Bc-XK的酶比活力为(20.56±3.31)U/mg,热稳定性好,在60℃保持活力180 min以上,具有很好的工业应用潜力。Bc-XK基因含有一个1 536 bp的开放阅读框,共编码511个氨基酸,其编码的蛋白质为亲水蛋白,等电点(PI)为5.46,分子质量为56.15 kDa,二级结构中α-螺旋、无规卷曲和延伸链含量丰富,3个催化位点分别为天冬氨酸-8、苏氨酸-11、天冬氨酸-239,高度保守。
- 聂恬孟未群李梦然张玉明倪志华
- 关键词：木酮糖激酶凝结芽孢杆菌克隆纯化生物信息学分析
- 抗菌肽的结构与功能研究被引量：15
- 2009年
- 抗菌肽是一种具有抗菌、抗病毒的天然活性物质。在基础理论研究领域,抗菌肽是研究生物大分子结构的重要材料。同时,其独特的生物抗菌活性又在医药工业具有广阔的应用前景。抗菌肽的结构组成与其生物活性密切相关。以3类典型抗菌肽为例,阐述多肽结构对于生理功能的重要性,以展示抗菌肽重要的理论及应用价值。
- 马玻张玉明倪志华周艳芬
- 关键词：抗菌肽杀菌肽
- 高效液相色谱法测定发酵液中杆菌肽A被引量：6
- 2011年
- 提出了高效液相色谱法测定发酵液中杆菌肽A含量的方法。地衣芽孢杆菌发酵液经离心得到杆菌肽A的粗提液。所得粗提液再经三氯乙酸提取,离心分离。取上清液用Beckman C18色谱柱分离,用乙腈和磷酸二氢钾缓冲溶液以不同体积比混合为流动相梯度洗脱,在220 nm波长处进行测定。杆菌肽A的质量浓度在1.0~15.0 g·L-1范围内与其峰面积呈线性关系,检出限（3S/N）为0.08 g·L-1。在7.37 g·L-1和11.01 g·L-1两个添加水平做回收试验,平均回收率分别为98.1%和97.4%。
- 张玉明倪志华李琳李宝库
- 关键词：高效液相色谱法地衣芽孢杆菌发酵液
- 利用一株凝结芽孢杆菌发酵酸解玉米秸秆生产乳酸被引量：5
- 2019年
- 该研究拟考察凝结芽孢杆菌(Bacillus coagulans)利用玉米秸秆生物炼制乳酸的效果。以凝结芽孢杆菌CGMCCNo.7635为菌种,利用2%硫酸预处理后的玉米秸秆为碳源、20g/L酵母粉为氮源,添加20FPU/g纤维素酶后开展糖化发酵生产乳酸实验。结果表明,发酵65h后可获得乳酸含量为(38.38±1.03)g/L,其中L-乳酸光学纯度为(99.23±0.22)%。进一步使用补料发酵工艺,添加经预处理的玉米秸秆,可最终获得乳酸含量为(82.56±1.28)g/L。建立的玉米秸秆生物炼制乳酸工艺操作简单、产物浓度高,具有工业应用潜力。
- 倪志华张玉明
- 关键词：乳酸玉米秸秆生物炼制木质纤维素凝结芽孢杆菌
- E2F家族转录因子在肿瘤发生中的作用
- 2023年
- 肿瘤严重威胁人类健康,转录因子是肿瘤治疗的潜在靶点。作为重要的转录因子家族,E2F在细胞增殖与调控进程中发挥重要作用。然而,E2F家族转录因子在肿瘤发生进程中的表达规律、基因功能和分子互作等关键信息尚不清晰。基于此,本研究对TCGA数据库中我国10种高发肿瘤的转录组测序数据、突变数据和蛋白质互作数据进行整合分析,探究E2F家族转录因子的表达、结构、功能、突变和系统发生特征。结果显示,E2F家族转录因子中的E2F1和E2F7基因在多种肿瘤样本中规律性上调表达,参与调控细胞周期、细胞衰老等信号通路;其中,E2F1作为重要的调控因子与其他蛋白的相互作用最多。值得指出的是,E2F家族转录因子的基因突变类型在肿瘤类型和患者性别中均存在差异,基因扩增占比最大。系统发生分析显示,E2F家族转录因子的结构在包括果蝇、线虫和人类在内41个物种中保守,并且它们在物种演化过程中表现出基因扩张倾向。综上所述,本研究阐明了E2F家族转录因子在我国高发肿瘤中的表达规律、突变特征和演化规律,提示E2F家族转录因子是相关肿瘤疾病的新型分子诊断标志物,为抗肿瘤靶向药物研发提供理论依据。
- 李飞飞王韵顾冀海张玉明柳峰松柳峰松
- 关键词：E2F1基因家族
- XeCl准分子激光辐照对溶菌酶结构的影响被引量：4
- 2011年
- 利用荧光光谱、SDS-PAGE和NMR方法,考察308 nm XeCl准分子激光辐照对溶菌酶结构与活性的影响。使用能量密度为0.3 mJ/mm2的激光辐照溶菌酶,脉冲数分别为25、50、100、200、600、1200、1800、3600和7200。结果表明,用低强度激光辐照(低于200个脉冲)时,溶菌酶的活性出现增高趋势。随着激光辐照脉冲数的进一步增大,溶菌酶的活性又开始逐步降低。激光辐照处理后,溶菌酶的荧光强度发生了与生物活性相对应的先增高再降低现象,说明溶菌酶的高级结构发生了显著变化。SDS-PAGE结果显示,经激光辐照后,溶菌酶出现了分子间的聚合。分析溶菌酶的1H-NMR谱发现,辐照后,溶菌酶色氨酸(Trp)111、Trp63和Trp62的化学位移发生了变化,此结果进一步说明,激光辐照使溶菌酶的高级结构发生了变化。该实验可为激光辐照诱导蛋白质去折叠的研究提供参考。
- 倪志华陈景春张玉明葛大勇赵晓辉王淑芳
- 关键词：激光辐照溶菌酶荧光光谱SDS-PAGE
- 自噬标志分子ATG8同源蛋白的生物信息被引量：3
- 2019年
- 自噬是细胞重要的代谢途径,ATG8在自噬体形成过程中起着重要的作用。对ATG8蛋白进行生物信息学分析研究十分必要。本研究以NCBI中人ATG8同源蛋白序列数据为研究材料,分析其与10种模式生物间基因拷贝数、氨基酸序列、蛋白质保守位点相关性。结果表明,人6种ATG8同源蛋白分别定位于5条染色体上,均有泛素样GABARAP结构域。并且,所有模式生物的ATG8同源蛋白中N-端氨基酸序列保守性强于C-端序列。本研究构建的ATG8同源蛋白系统发育树显示,人的ATG8同源蛋白与脊椎动物(斑马鱼,爪蟾,小鼠,大鼠,牛)的ATG8蛋白亲缘关系更近,人的GABARAPs与酵母的ATG8蛋白与的亲缘关系较近。本研究为研究细胞自噬过程及机制提供了丰富的生物进化和生物信息数据支持。
- 倪志华刘阿显杨会然樊瑞阳李宝库
- 关键词：自噬生物信息进化
- 壳寡糖诱导肺癌细胞A549凋亡及其机制初探被引量：2
- 2013年
- 目的研究壳寡糖对人肺癌细胞A549的增殖抑制作用及对凋亡相关蛋白Bcl-2、Bax、Survivin表达的影响。方法利用金属配位氧化法制备壳寡糖,采用噻唑蓝(MTT)法检测不同浓度的壳寡糖处理不同时间对A549细胞增殖的抑制作用,Wright's-Giemsa染色后观察壳寡糖处理后的A549的形态学变化,利用免疫组织化学法分析壳寡糖对A549细胞中Bcl-2、Bax、Survivin表达量的影响。结果 5.0 mg/ml壳寡糖处理A549细胞48 h后对细胞增殖的抑制率为56.70%。荧光显微镜下观察Wright's-Giemsa染色后细胞的细胞膜褶皱,细胞核固缩,并出现凋亡小体。免疫组织化学法分析表明,壳寡糖能够上调促凋亡蛋白Bax的表达,下调抑制凋亡蛋白Bcl-2、Survivin的表达。结论壳寡糖对人肺癌A549细胞的增殖有抑制作用,推测其可能通过上调Bax和下调Bcl-2、Survivin的表达诱导细胞凋亡。
- 杨欢欢周艳芬武金霞郝江叶倪志华王振山
- 关键词：壳寡糖A549细胞BAX
- 杆菌肽与牛血清白蛋白相互作用的荧光光谱被引量：3
- 2016年
- 利用荧光光谱法研究杆菌肽与牛血清白蛋白的相互作用,结果表明,杆菌肽可使牛血清白蛋白的内源荧光发生猝灭。在不同温度下研究杆菌肽对牛血清白蛋白的荧光猝灭作用,利用Stern-Volmer方程处理试验数据,证明荧光猝灭机理属于静态猝灭。杆菌肽与牛血清白蛋白具有1个结合位点,计算得到不同温度下杆菌肽与牛血清白蛋白的结合常数(KA)为3.38×104L/mol(298 K)、2.92×104L/mol(308 K)、1.56×104L/mol(318 K)。通过计算热力学参数可知,杆菌肽与牛血清白蛋白的相互作用是吉布斯自由能降低的自发过程,且二者间的主要作用力类型为静电作用。三维荧光光谱试验显示,杆菌肽的加入引起牛血清白蛋白构象的变化,表现为蛋白质内部色氨酸残基所处微环境的疏水性降低。
- 张玉明倪志华
- 关键词：牛血清白蛋白相互作用荧光光谱猝灭热力学参数
