冯旭芳
- 作品数:26 被引量:86H指数:6
- 供职机构:贵州大学动物科学学院更多>>
- 发文基金:贵州省农业科技攻关项目贵州省重大科技专项计划项目贵州省科学技术基金更多>>
- 相关领域:农业科学生物学医药卫生环境科学与工程更多>>
- 贵州省猪流行性腹泻病毒ORF3、M基因克隆及序列分析被引量:7
- 2016年
- 为了解贵州省猪流行性腹泻病毒(porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)毒株ORF3及M基因的遗传变异情况,试验于2014年4月-2015年3月从贵州省5个地区采集105份腹泻仔猪的粪便,应用RT-PCR方法进行PEDV检测,从中选择8份PEDV阳性样本,扩增其ORF3及M基因,测序并进行序列比对分析。结果显示,从采集的105份粪便样本中可检出75份PEDV阳性样本,阳性率为71.43%;8株PEDV贵州株ORF3及M基因序列均无碱基缺失或插入;ORF3基因核苷酸及推导的氨基酸同源性在95.1%-100.0%与95.1%-99.6%之间,M基因核苷酸及推导的氨基酸同源性在98.4%-100.0%与98.7%-100.0%之间;氨基酸系统进化树分析结果显示,2014-2015年贵州流行株与近年来中国毒株、韩国毒株及泰国毒株亲缘关系较近,与疫苗株Attenuated DR13及CV777株亲缘关系较远。提示目前贵州省仔猪腹泻病原主要是PEDV,且为PEDV强毒株。
- 冯旭芳周碧君张双翔王跃章文明程振涛毛黎红王开功
- 关键词:猪流行性腹泻病毒ORF3基因M基因克隆
- 2011-2013年贵州猪瘟流行病学调查
- 引言猪瘟(Classical swine fever,CSF)是由黄病毒科瘟病毒属的猪瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)引起的一种高度接触性传染和致死性传染病,猪是猪瘟病毒的唯一自...
- 冯旭芳王开功周碧君文明程振涛温贵兰尹鑫毛黎红
- 德菲尔法构建禽流感预警指标体系被引量:1
- 2016年
- 为构建禽流感发生流行预警指标体系,采用文献调研法和德菲尔专家咨询法初拟禽流感暴发预警体系的框架及其指标,应用德菲尔专家咨询法评价预警指标重要性、可操作性和专家权威程度,并用组合权重法确定权重分析指标。确定了禽流感预警6个一级指标(易感动物、饲养管理和气象因素等)以及14项二级指标(免疫效果、环境消毒、温度等),并成功将二级指标分为3档(关键、重要和一般指标)。初步构建了禽流感发生流行预警预指标体系,该体系将为禽流感发生预警提供科学依据。
- 李沛丽周碧君张华李涛徐秋星文明王开功程振涛温贵兰冯旭芳
- 关键词:禽流感预警
- 牛乳头状瘤病毒贵州株L1基因克隆及生物信息学分析被引量:8
- 2016年
- 为分析牛乳头状瘤病毒贵州株(BPV-GZ01株)L1基因的分子特征,预测其编码蛋白的生物学功能,本试验对BPV-GZ01株L1基因进行PCR扩增、克隆及序列测定。应用生物信息学相关软件及方法对BPV-GZ01株L1基因进行序列分析,并对其编码蛋白进行二级结构、三级结构、B细胞表位、保守结构域、跨膜结构域和信号肽预测。结果显示,L1基因序列全长为1 494bp,编码497个氨基酸;与BPV2、BPV2-SW01、BPV2-AKS01、BPV13、BPV1株相应序列核苷酸同源性分别为99.1%、99.8%、99.4%、87.6%和82.8%,氨基酸同源性分别为98.6%、99.4%、98.4%、94.4%和91.3%;系统进化树显示,BPV-GZ01株与BPV2-SW01株亲缘关系最近;L1蛋白二级结构以无规则卷曲、β-折叠和α-螺旋区域所占比例较大,预测此蛋白可能存在6个B细胞优势抗原表位,无跨膜区域,无信号肽区域;三级结构呈弯曲状螺旋结构。本研究结果将为贵州省BPV免疫诊断及核酸疫苗研究提供理论依据。
- 张海周碧君杨忠成廖梅王开功文明程振涛王伟冯旭芳
- 关键词:L1基因生物信息学分析蛋白结构预测
- 家禽禽流感预警预报指标体系研究
- 李沛丽周碧君张华李涛王开功文明程振涛温贵兰冯旭芳
- 猪流行性腹泻病毒RT-LAMP检测方法的建立与应用被引量:11
- 2017年
- 针对猪流行性腹泻病毒(PEDV)的M基因设计LAMP引物,对反应体系的条件优化并进行特异性及敏感性等试验。结果显示:该方法在60℃下恒温扩增60min,使PEDV的M基因得到了高效率特异性扩增。本试验方法特异性好,与猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRSSV)、猪圆环病毒2型(PCV-2)、猪细小病毒(PPV)及猪伪狂犬病病毒(PRV)等无交叉反应,同时也具有较好的灵敏性,最低检测分子拷贝数为1.0×102 copies/μL。反应结束后加入SYBR GreenⅠ在紫外灯下观察颜色变化,结果显示阳性扩增产物呈现绿色荧光。结果表明:该LAMP检测方法特异性强,灵敏度高,操作便捷,适于临床检测PEDV。
- 王伟张双翔金志强周碧君文明程振涛冯旭芳张海唐宇王开功
- 关键词:猪流行性腹泻病毒RT-LAMPM基因
- 贵州省部分地区规模化猪场4种致猪腹泻病毒感染调查
- 引言腹泻是养猪生产中常见的一类疾病,是导致大批猪群死亡的重要原因之一,由于该病传播迅速,引起猪群腹泻、呕吐、脱水以及对哺乳仔猪高死亡率,对机体造成严重损伤.即使仔猪耐过存活,但该猪生长缓慢,致使饲料报酬降低,增加养殖成本...
- 毛黎红王开功周碧君文明程振涛温责兰冯旭芳
- 猪流行性腹泻病毒贵州株部分S基因原核表达质粒的构建
- 2015年
- 为给贵州猪流行性腹泻(PED)的诊断及防治提供科学依据,同时为猪流行性腹泻病毒(PEDV)部分S蛋白进一步表达建立相应检测方法奠定理论基础,利用贵州PEDV分离株,参考GenBank登录PEDV CV777株的S基因序列,选取主要抗原区域(COE)设计1对PEDV COE基因特异性引物,进行部分保护性抗原COE基因的PCR扩增,扩增产物与pMD19-T载体链接,鉴定正确后再亚克隆至pET32a位置,结果成功构建了贵州PEDV分离株COE基因的原核表达质粒,分离株COE基因与HBQX株的序列同源性达99.1%,与经典毒株CV777株的同源性为93.4%。
- 何玉侠毛黎红周碧君王开功文明程振涛温贵兰冯旭芳潘廷云张艳刘长素
- 关键词:猪流行性腹泻病毒原核表达质粒构建
- 猪轮状病毒贵州株VP7基因克隆及序列分析
- 猪轮状病毒(Porcine rotavirus,PRV)属呼肠孤病毒科(Reoviridae)轮状病毒属(Rotavirus),VP7是PRV的外衣壳蛋白,也是一种糖基化蛋白,由326个氨基酸组成,因不同毒株而异,分别由...
- 冯旭芳王开功周碧君文明程振涛温贵兰毛黎红
- 关键词:猪轮状病毒基因克隆基因序列
- 文献传递
- 近3年贵州省猪瘟流行病学初步调查被引量:6
- 2016年
- 为了解近3年贵州省猪瘟(CSF)的免疫水平和隐性感染情况,分别采用ELISA及RT-PCR方法对2011—2013年全省9个地(州、市)部分猪群采集的5 268份CSF免疫血清样本及2 552份临床健康猪扁桃体和淋巴结组织样本进行CSF血清抗体检测和病原核酸检测。结果表明:近3年CSF血清抗体免疫合格率为41.05%~69.16%,合格率为2013年〉2011年〉2012年;不同样本来源CSF免疫合格率为养殖小区〉规模场〉散养户〉屠宰场;一年四季CSF免疫合格率为春季〉秋季〉夏季〉冬季。3年CSF病原核酸阳性检出率为0.37%~1.53%,2011年〉2013年〉2012年;不同样本来源CSFV阳性检出率为屠宰场〉养殖小区〉散养户〉规模场;一年四季CSFV感染率为冬季〉夏季〉秋季〉春季。结果说明贵州省2011—2013年CSF免疫合格率总体水平低于农业部≥70%的要求,CSF以点状散发为主。
- 冯旭芳尹鑫云婷周碧君文明程振涛温贵兰王开功
- 关键词:流行病学调查ELISART-PCR