杜嵇华 作品数:6 被引量:28 H指数:4 供职机构: 华中农业大学 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家高技术研究发展计划 国家重点基础研究发展计划 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 医药卫生 更多>>
一种易驯食人工饲料鳜鱼相关基因SNP分子标记 本发明属于鱼的育种技术领域,涉及分子标记技术领域。本发明具体涉及一种用于检测与驯食人工饲料鳜鱼相关基因多态性的SNP分子标记,其特征在于,所述的分子标记是下列基因片段所对应的核苷酸序列:(1)神经肽Y基因的SNP分子标记... 梁旭方 何珊 杨宇晖 方荣 曹亮 杜嵇华 何焱 符云 叶卫文献传递 一种易驯食人工饲料鳜鱼相关基因SNP分子标记 本发明属于鱼的育种技术领域,涉及分子标记技术领域。本发明具体涉及一种用于检测与驯食人工饲料鳜鱼相关基因多态性的SNP分子标记,其特征在于,所述的分子标记是下列基因片段所对应的核苷酸序列:(1)神经肽Y基因的SNP分子标记... 梁旭方 何珊 杨宇晖 方荣 曹亮 杜嵇华 何焱 符云 叶卫草鱼脂肪酸去饱和酶和延长酶基因cDNA全序列的克隆与分析 被引量:8 2011年 利用RT-PCR和RACE方法克隆得到草鱼(Ctenopharyngodon idellus)肝脏中控制高不饱和脂肪酸(HU-FA)合成的脂肪酸去饱和酶(FAD)和脂肪酸延长酶(ELO)基因cDNA全序列.结果表明,草鱼FAD基因cDNA全长为1 994 bp,开放阅读框(ORF)为1 332 bp,编码444个氨基酸.编码的蛋白序列包含FAD全部特征结构区,包括3个组氨酸簇、2个跨膜区和1个细胞色素b5结构域,与其他鱼类的FAD氨基酸序列具有63.5%~70.5%的同源性.通过系统树分析,显示其在系统树中与草食性淡水鱼的亲缘关系最近.克隆得到的草鱼ELO的全长cDNA序列1 131 bp,含有876 bp的ORF,编码291个氨基酸.该蛋白序列含有单一的氧化还原中心组氨酸簇、内质网停留信号和多个跨膜区等ELO特征结构,与其他类别ELO氨基酸具有70.6%~89.3%的同源性.系统树分析显示其在系统树中与草食性和杂食性淡水鱼类亲缘关系较近.草鱼FAD和ELO cDNA全序列的获得为今后进一步研究其体内高不饱和脂肪酸合成途径及阐明该途径在不同鱼类中的分子进化机理奠定基础. 杜嵇华 梁旭方 程佳齐 朱滔 朱择敏 郁颖关键词:脂肪酸去饱和酶 草鱼 基因克隆 草鱼NPY对摄食及相关基因表达的影响 神经肽Y (Neuropeptide Y, NPY)是一种短单链多肽,是促进脊椎动物摄食的一个重要诱导因子,通过其受体(NPYY)对哺乳动物的摄食行为进行一定的调控,但是关于NPY在鱼类中的作用了解较少。 本论文通过克隆... 杜嵇华关键词:草鱼 摄食 代谢 基因表达 文献传递 鳜胃蛋白酶基因外显子7上SNP检测及其与食性驯化相关分析 被引量:6 2011年 本研究旨在探寻胃蛋白酶(pepsinogen,PEP)基因的等位基因及其基因型在不同食性驯化表型鳜(Siniperca chuatsi)群体中的分布情况。通过2周食性驯化,挑选出最易驯化和最不易驯化的2组,提取各组鳜鳍条组织DNA,采用PCR产物直接测序法(direct sequencing,DS)、限制性片段长度多态性技术(restriction fragment length poly-morphism,RFLP)和创造限制酶切位点PCR法(created restriction site PCR,CRS-PCR)对鳜胃蛋白酶基因5、6、7、8内含子和6、7、8外显子进行SNPs遗传多态性检测和分析。结果共检测到2个SNPs位点(C1T和C52 T),均为同义突变,利用卡方检验分析,结果表明PEP基因的这2个SNPs位点分别与鳜的食性驯化不具显著相关性(P>0.05)。将2个SNPs位点的不同基因型组合成5种双倍型,卡方检验表明双倍型Dip1与Dip5在两组中存在显著差异(P<0.05)。本研究成功完成鳜PEP基因组多态性分析,因而可以考虑将PEP基因作为影响鳜食性驯化的候选基因。 方荣 梁旭方 杨宇晖 杜嵇华 曹亮 叶卫 符云关键词:胃蛋白酶 SNP 食性驯化 草鱼过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)基因cDNA序列的克隆及其组成型表达 被引量:9 2011年 过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)是核激素受体超家族成员之一,分α,β,γ3个亚型,PPAR具有多种生物学效能,对其基因进行研究将有助于揭示草食性鱼类对营养物利用规律及其机制.通过简并引物克隆草鱼(C tenopharyngodon idellus)PPAR基因cDNA核心序列,应用3′RACE技术扩增该序列的3′末端序列,并对其进行序列分析,最后用荧光定量PCR方法比较草鱼肝脏、脑、脾脏、肌肉、脂肪和心脏的PPARα、PPARβ和PPARγ基因mRNA相对表达水平.序列分析结果表明,草鱼PPARα、PPARβ和PPARγ基因cDNA核心序列片段大小为631 bp,604 bp和651 bp,分别编码210、201和217个氨基酸,PPARγ经3′RACE后共获得大小为1331 bp的片段,编码337个氨基酸.草鱼与鲤鱼(Cyprinus carpio)、斑马鱼(Danio rerio)、鲈鱼(Lateolabrax japonicus)等鱼类PPAR氨基酸序列同源性很高,为71.4%~96.1%;与人(Homo sapiens)、大鼠(Rattus norvegicus)、小鼠(Mus musculus)、牛(Bos taurus)等哺乳动物PPAR氨基酸序列的同源性也较高,为65.0%~77.6%;与非洲爪蟾(Xenopus laevis)等两栖动物PPAR氨基酸序列的同源性约为67.0%.荧光定量PCR结果表明,草鱼PPARα于肝脏,PPARβ于肝脏、肌肉和心脏,PPARγ于肝脏的表达相对较高.相同物种不同PPAR亚型的同源性较低,而不同物种同型PPAR同源性很高,反映了不同亚型在结构上的差异,这与其在功能上的差异是相一致的. 陈亮 梁旭方 瞿春梅 杜嵇华 刘秀霞 何珊关键词:草鱼 克隆 组成型表达