廖丽
- 作品数：15 被引量：17H指数：2
- 供职机构：中国极地研究中心更多>>
- 发文基金：上海市自然科学基金国家高技术研究发展计划国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学农业科学医药卫生轻工技术与工程更多>>
- 北极海洋链霉菌基因组测序与次级代谢产物潜力分析
- 从北冰洋Chukchi Cap的沉积物中分离到一株具有较好抗菌活性、并表现出产生丰富次级代谢产物潜力的放线菌Streptomyces sp.604F。通过Illumina HiSeq 2000双向测序基因组,获得1,35...
- 廖丽陈波
- 文献传递
- 一种北极拟诺卡氏菌及其发酵产物优化方法
- 本发明公开了北极拟诺卡氏菌Nocardiopsis sp.Y469及其发酵培养方法，属于生物技术领域。所述北极拟诺卡氏菌Nocardiopsis sp.Y469分离自北冰洋3700米海底的沉积物，该菌株已于2018年8月...
- 廖丽俞勇陈波苏世源
- 文献传递
- 基于一株北极海洋假交替单胞菌基因组的L-卤酸脱卤酶的克隆、表达及性质初步分析
- 卤化有机物(HOC)是广泛分布在环境中的一类主要污染物，其来源包括农业中经常使用的杀虫剂、以及合成化学工业中的副产物.此外，也有生物来源的HOC.HOC上的卤元素可以被脱卤酶去除，因此脱卤酶不但在卤化污染物去毒的生物修复...
- 廖丽曾胤新罗玮俞勇
- 细菌抗冻蛋白研究进展及其应用潜力分析被引量：2
- 2021年
- 抗冻蛋白是一类在低温下抑制冰晶生长从而保护细胞免受冰晶伤害的特殊蛋白质。抗冻蛋白来源广泛,包括鱼类、昆虫、植物、细菌、藻类和真菌等。相比动植物来源的抗冻蛋白,目前针对细菌来源抗冻蛋白缺乏系统性综述与分析。因此重点描述了细菌来源抗冻蛋白的研究进展,并以其中活性较高、研究较多的4个抗冻蛋白来源种属为代表,详细介绍了细菌抗冻蛋白目前的研究现状、发展前景和应用潜力。
- 高山惠廖丽胥义胥义
- 关键词：细菌抗冻蛋白
- 南极乔治王岛冰锥洞微生物培养探索
- 2023年
- 【目的】南极洲具备独特的环境和相对的生物地理隔离,南极洲各类生境中蕴藏了大量尚未培养和难培养的微生物,也是新颖微生物物种的重要来源之一。本研究以南极冰锥洞这类特殊生境为研究对象,通过培养条件的多样化提升南极微生物的培养率和多样性,揭示南极冰锥洞可培养微生物类群多样性,为该环境可培养微生物功能研究奠定基础,也为南极极端环境未培养微生物的培养方法提供借鉴。【方法】通过采用不同培养基添加复苏促进因子(resuscitation promoting factor, Rpf)的方式,提高南极柯林斯冰盖冰锥洞生境中微生物的可培养率,探究该生境中微生物的多样性。采用4种不同营养水平的培养基,平行添加Rpf进行菌株培养,经分离纯化与16S rRNA基因鉴定,分析冰锥洞可培养微生物的多样性及培养条件对多样性的影响。【结果】本研究共分离培养细菌407株,涵盖5个门、18个科、29个属,其中:放线菌门(Actinomycetota)为优势门,占72.73%;微杆菌科(Microbacteriaceae)为优势科,占69.78%;Lacisediminihabitans属为优势属,占45.70%。从培养基效果分析,培养出菌株数从多到少依次为:R2A培养基(188株)>1/2R2A+Rpf培养基(144株)>1/2R2A培养基(46株)>R2A+Rpf培养基(14株)>TSB+Rpf培养基(9株)>TSB培养基(3株)=LB培养基(3株)。而LB+Rpf培养基未培养出微生物。按照文献建议的16SrRNA基因序列相似性98.65%以下为潜在新种依据,分离得到的菌株中共有69株为潜在新菌,涵盖19个潜在新种,分离潜在新种率较高的培养基为R2A培养基、1/2R2A培养基以及1/2R2A+Rpf培养基。【结论】本研究共采用8种不同的培养基组合,从南极冰锥洞样品中获得了一定量的可培养细菌,提示了不同培养基添加复苏促进因子对菌株生长的促进作用,并获得多个潜在新种。分离获得的菌株具有较高的多样性,为今后利用不同培养基策略分离极地特殊环境未
- 毛梦婷张瑾文姣陈波廖丽
- 关键词：微生物多样性
- 极地微生物基因组挖掘现状与展望被引量：2
- 2020年
- 测序技术的快速发展极大地促进了微生物基因组相关研究。极地微生物基因组的测序与研究虽然启动略晚,但迅速成为极地微生物研究的一个重要内容。极地微生物基因资源具有重要的战略意义与社会效益,但针对极地微生物基因组的深入研究以及基因资源的深度挖掘仍然非常有限,没有真正发挥基因组测序的作用与价值。本文总结了国际上极地微生物基因组相关研究现状与主要的研究方向,分析了极地微生物基因组挖掘潜力与目前研究的不足之处,并在此基础上提出了重点需要突破的方向。极地微生物基因资源潜力巨大,加强对极地微生物基因资源的挖掘将为未来生物技术的发展提供更多可能性。
- 廖丽陈波
- 关键词：极地微生物基因组基因资源
- 北冰洋海单胞菌β-D-半乳糖苷酶的异源表达及酶学特性研究被引量：1
- 2015年
- 初筛表明,一株分离自北极加拿大海盆海冰心芯样品的海单胞菌（Marinomonas sp.BSi20584）具有较高的β-D-半乳糖苷酶活性,为了研究清楚其酶学性质,将经hiTAIL-PCR扩增得到的β-D-半乳糖苷酶基因（galt）与pET-28a（＋）原核表达载体结合,转入大肠杆菌BL21（DE3）。经IPTG诱导后对重组β-D-半乳糖苷酶（GALT）的表达条件进行了优化,采用金属螯合亲和层析技术制备纯酶,并对重组GALT的酶学性质进行了研究。结果显示,重组酶的最适诱导温度为20℃,在IPTG浓度为0.07mmol/L时诱导22h后,酶活和产酶量达到最大值。GALT单体分子量约为6.6×104 g/mol,天然酶为同源三聚体。GALT最适作用温度为35℃,其热稳定性较好,在60℃处理5h后,仍可保持50%以上的相对活性。GALT的最适作用pH为9.0,在pH为6.0~11.0范围内比较稳定。GALT的最适NaCl浓度为0.5mol/L,对盐度具有较高的耐受性。Mg2＋、K＋、DTT和EDTA对酶活不具有显著影响,而Mn2＋、Fe2＋对酶活有促进作用,Zn2＋和L-谷胱甘肽对酶活有抑制作用。GALT对Galβ1-4GlcNAc具有水解作用,而对Galβ1-3GalNAc和Galβ1-3GlcNAc糖苷键型没有水解能力。本研究实现了海单胞菌属菌株的β-D-半乳糖苷酶基因在大肠杆菌系统中的高效表达,并系统研究了重组酶的酶学特性,为后续开展该酶的代谢适应性和潜在应用研究提供详细的酶学数据基础。
- 孙茜廖丽丁海涛刘双陈波
- 关键词：Β-D-半乳糖苷酶异源表达酶学特性
- 北极海洋链霉菌604F的卤化酶基因克隆及特征被引量：10
- 2014年
- 【目的】本研究旨在克隆来自北极海洋、具有合成卤化物潜力的链霉菌(Streptomyces sp.)604F中的一个卤化酶基因,为后续克隆卤化物合成基因簇、分离鉴定卤化物提供指导。【方法】利用琼脂块法初步测试抗菌活性,借助液相色谱-飞行时间串联质谱技术(LC-Tof MS)初步寻找Streptomyces sp.604F发酵粗提液中的卤化物,并以简并PCR扩增合成次级代谢产物的指示基因(I型、II型聚酮合酶及非核糖体多肽合成酶编码基因);根据依赖黄素腺嘌呤二核苷酸的卤化酶基因保守区设计的简并引物,扩增基因片段并测序分析;采用高效热不对称交错PCR(hiTAIL-PCR)技术扩增卤化酶基因全长。【结果】Streptomyces sp.604F具有较强的抗白色念珠菌活性,其基因组同时含有编码I型聚酮合酶、II型聚酮合酶和非核糖体多肽合成酶基因,以及卤化酶基因;通过染色体步移克隆该卤化酶基因全长,共1443 bp,编码一个新的非色氨酸卤化酶,在合成已知卤化物的卤化酶数据库中,与其同源关系最近的为一类参与合成糖肽类次级代谢产物的卤化酶。【结论】Streptomyces sp.604F具有新的非色氨酸卤化酶,且推测参与糖肽类化合物的卤化修饰,为后续寻找目的卤化物提供了指导,也为研究该合成基因簇奠定基础。
- 陈瑞勤廖丽张晓华陈波
- 关键词：放线菌
- 北冰洋海洋放线菌多样性及其基因资源研究
- 从北冰洋楚科奇海和加拿大海盆的22个表层沉积物样品中,分离得到135个放线菌菌株.16SrRNA基因序列分析表明,这些菌株归属于18个属,其中链霉菌属最多,其次为拟诺卡氏菌属、红球菌属、盐细菌属.针对75个代表菌株进行基...
- 廖丽罗玮俞勇刘欢刘双陈波
- 关键词：放线菌多样性基因簇
- 北极海洋放线菌Streptomyces sp.604F中的抗霉素A和伏尔加霉素类成分被引量：1
- 2016年
- 极地微生物代谢产生芳香族硝基化合物、肽类、萜类等多种骨架类型的化学成分。为从北极放线菌中发现结构新颖、活性显著的小分子化合物,本研究采用Sephadex LH-20凝胶和半制备HPLC等柱层析分离纯化化合物手段,结合LC-MS、1H-和13C-NMR等波谱学数据和文献对比进行结构解析,从链霉菌Streptomyces sp.604F提取物中分离鉴定出抗霉素A1b(1)、抗霉素A4a(2)、抗霉素A2a(3)、抗霉素A3a(4)、抗霉素A1a(5)以及伏尔加霉素(6)和8-脱氧伏尔加霉素(7)这7个化合物。化合物1—7是首次从北极海洋沉积物来源的微生物中发现,而且是首次从同一菌株中发现抗霉素A和伏尔加霉素这两类化合物。
- 江昇平田晓清廖丽杨桥陆亚男马丽艳陈波樊成奇
