王婉
- 作品数：10 被引量：26H指数：3
- 供职机构：华南农业大学更多>>
- 发文基金：公益性行业(农业)科研专项国家现代农业产业技术体系建设项目更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生更多>>
- 应用TaqMan real-time PCR研究BSV在带毒香蕉组培苗中传递被引量：1
- 2017年
- 由香蕉线条病毒(Banana streak virus,BSV)引起的香蕉线条病,严重影响了香蕉产量及种质资源交流。本研究根据BSV ORF Ⅲ基因保守序列设计引物和探针,建立了BSV的实时荧光定量PCR检测方法。该法检测BSV时,与黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)和香蕉束顶病毒(Banana bunchy top virus,BBTV)无交叉反应;不论是检测质粒DNA还是香蕉病株总DNA,其灵敏度都比普通PCR高,检测质粒DNA的灵敏度比普通PCR高100倍,检测香蕉病株总DNA的灵敏度比普通PCR高10倍,且具有良好的重复性。利用建立的实时荧光定量PCR方法检测我国主栽的不同香蕉品种‘大蕉’、‘粉蕉’和‘粤优抗一号’香蕉组培苗中BSV的浓度,发现不同品种BSV传递规律不同。‘大蕉’第3代、第9代组培分化芽中BSV含量较原代显著减少;‘粉蕉’中BSV含量随继代数增加表现为先增加后减少;‘粤优抗一号’中BSV含量随继代数增加呈增加趋势。BSV在‘粉蕉’、‘大蕉’和‘粤优抗一号’第10代到第12代组培苗中以顶部第1片或(及)第2片叶中含量最高。直接结合PCR分析初步表明不同品种在原代和组培至第12代,其植株中的BSV均为游离状态。本文通过对带毒香蕉组培苗中BSV的含量监测,明确了BSV在不同品种带毒香蕉组培苗中的传递和分布规律,为研究BSV与寄主互作及BSV检测提供了理论依据。
- 孙洁王婉饶雪琴李华平
- 关键词：香蕉线条病毒香蕉品种组培苗实时荧光定量PCR
- 香蕉束顶病毒实时荧光PCR检测方法的建立被引量：3
- 2016年
- 根据香蕉束顶病毒(Banana bunchy top virus,BBTV)复制酶基因保守序列设计特异性探针及引物,建立了BBTV实时荧光PCR(Taq Man real-time PCR)检测方法。结果显示,所建立的检测方法在检测质粒DNA标准品和发病香蕉植株总DNA时,其灵敏度均比普通PCR高,且与黄瓜花叶病毒(Cucumber mosaic virus,CMV)和香蕉线条病毒(Banana streak virus,BSV)无交叉反应。同浓度样品进行7次重复性试验,各重复扩增结果所得Ct值的变异系数为0.93%,表明建立的荧光定量PCR检测方法重复性好,Ct值保持稳定。利用所建立的方法检测带毒香蕉吸芽繁殖的组培苗中的BBTV,发现BBTV含量随着继代数的增加而增加,并且组培苗顶部叶片中的含量高于其他部位的叶片。
- 孙洁王婉饶雪琴李华平
- 关键词：香蕉香蕉束顶病毒实时荧光定量PCR
- 来源于广东的一株香蕉线条病毒分离物的全基因组序列分析
- 香蕉是世界四大水果之一,其在世界水果生产中有着极其重要的经济地位.我国是香蕉生产第三大国,广泛种植于广东、海南、云南和广西等各省,是我国热区农业重要的一个支柱产业.由香蕉线条病毒(banana streak virus,...
- 王婉饶雪琴孙洁周翎李华平
- 关键词：香蕉线条病毒基因组
- 番木瓜环斑病毒海南分离物遗传多样性及对转基因番木瓜抗性的影响
- 番木瓜(Caricapapaya L.)是一种热带和亚热带地区广泛种植的一类具有较高营养价值的经济作物,而番木瓜环斑病毒(papaya ringspot virus,PRSV)是番木瓜生产中最重要的一个限制因子,自200...
- 吴自林王婉谢晚彬林凡瑜阮小蕾李华平
- 关键词：番木瓜环斑病毒衣壳蛋白基因复制酶基因
- 文献传递
- 番木瓜环斑病毒海南分离物遗传多样性及对转基因番木瓜抗性的影响
- 番木瓜(Carica papaya L.)是一种热带和亚热带地区广泛种植的一类具有较高营养价值的经济作物,而番木瓜环斑病毒(papaya ringspot virus,PRSV)是番木瓜生产中最重要的一个限制因子,自20...
- 吴自林王婉谢晚彬林凡瑜阮小蕾李华平
- 关键词：番木瓜环斑病毒衣壳蛋白基因复制酶基因
- 黄瓜花叶病毒荧光定量PCR检测方法的建立被引量：9
- 2014年
- 【目的】建立检测香蕉中黄瓜花叶病毒Cucumber mosaic virus(CMV)的实时荧光定量方法.【方法】根据CMV外壳蛋白(CP)保守序列设计了TaqMan实时荧光定量PCR特异性探针及引物,优化反应体系检测TaqMan探针实时荧光定量方法的灵敏度、特异性和重复性.【结果和结论】该方法检测灵敏度为4.2×102μL-1,比普通PCR高100倍,且与香蕉束顶病毒Banana bunchy top virus(BBTV)、香蕉线条病毒Banana streak virus(BSV)无交叉反应,特异性和重复性都较好.用实时荧光定量PCR检测14份田间香蕉样品有5份样品为阳性,进一步证明建立的实时荧光定量方法可用于香蕉CMV的检测.
- 孙洁王婉周翎阮小蕾饶雪琴李华平
- 关键词：黄瓜花叶病毒TAQMAN探针
- 黄瓜花叶病毒在香蕉不同品种组培过程中的症状和传递规律被引量：1
- 2016年
- 以感染黄瓜花叶病毒（Cucumber mosaic virus,CMV）的不同基因型香蕉分化芽为研究对象,利用肉眼观察、RT-PCR和实时定量荧光PCR方法研究CMV在不同感病香蕉分化芽中的症状及传递规律。结果表明,感染CMV的‘粤优抗一号’、‘威廉斯’、‘大蕉’和‘皇帝蕉’在组培过程的第1代至第12代病害症状均不明显。随着组培继代数增加,不同品种的组培苗中CMV含量变化虽然不同,但均在顶部第1-2叶中含量最高。因此,检测香蕉分化芽中CMV最佳材料为顶部叶片。
- 孙洁王婉饶雪琴李华平
- 关键词：黄瓜花叶病毒实时荧光PCR症状
- 香蕉细菌性软腐病菌XJ8-3-3基因组中ORFs的信号肽及分泌蛋白功能预测分析被引量：12
- 2014年
- 【目的】利用香蕉细菌性软腐病菌XJ8-3-3全基因组测序结果对其信号肽进行预测和分析,为深入研究其分泌蛋白、明确香蕉与病原微生物互作的分子机制奠定基础。【方法】应用Signal Pv4.1、TMHMMv2.0、THUMBUP、Target P1.1、Lipo P1.0、Tat P1.0、big-PI predictor 7个软件对香蕉细菌性软腐病菌基因组中4 313个ORFs进行预测分析,并通过swisspot数据库预测信号肽所在ORFs的功能。【结果】香蕉细菌性软腐病菌中存在具有信号肽的ORFs 218个,占其基因组编码ORFs的5.05%,其中有184个ORFs属于Ⅰ型信号肽,32个ORFs属于Ⅱ型信号肽,2个ORF为CYT型,未发现Prepilin-like型信号肽的存在。在所有分泌蛋白中,有122个具有可预测的功能,其余96个为功能未知的推定蛋白。【结论】解析了香蕉细菌性软腐病菌基因组ORFs中的信号肽及分泌蛋白的可能功能,发现存在很多果胶酶、蛋白酶、纤维素酶等致病因子和一系列其他可能的致病因子,这为后续致病机理的研究提供了众多候选基因。
- 肖文超范会云白亭亭白亭亭李华平
- 关键词：信号肽分泌蛋白
- 来源于广东的一株香蕉线条病毒分离物的全基因组序列分析
- 香蕉是世界四大水果之一,其在世界水果生产中有着极其重要的经济地位。我国是香蕉生产第三大国,广泛种植于广东、海南、云南和广西等各省,是我国热区农业重要的一个支柱产业。由香蕉线条病毒(banana streak virus,...
- 王婉饶雪琴孙洁周翎李华平
- 关键词：香蕉线条病毒基因组
- 文献传递
- 侵染香蕉的黄瓜花叶病毒遗传多样性分析
- 2023年
- 为明确侵染香蕉的黄瓜花叶病毒(cucumber mosaic virus,CMV)的遗传多样性,对2012—2020年采集自广东、广西、云南和海南4省区的98份疑似感染CMV香蕉样品进行反转录PCR(reverse transcription PCR,RT-PCR)检测,从确定感染香蕉样品中获得CMV分离物并对其外壳蛋白(coat protein,CP)编码基因进行克隆和序列分析,结合Gen Bank已报道的CMV CP基因序列进行种群结构及遗传多样性分析。结果表明,98份疑似样品中有39份感染了CMV,侵染香蕉的CMV分离物CP基因核苷酸序列相似率为82.9%~100.0%,大多数高于90.0%。系统进化分析结果表明,39个CMV香蕉分离物分为3个不同进化支,即进化支IA-a、IB-a和IB-b,都属于亚组Ⅰ,未发现归入亚组Ⅱ的CMV香蕉分离物。CMV不同进化支内的遗传距离为0.005~0.069,亚组Ⅱ与亚组Ⅰ之间的遗传距离大于亚组I内的遗传距离。遗传分析结果表明,CMV各种群的单倍型多样性Hd值均大于0.521,大部分种群的核苷酸多样性Pi值大于0.005;遗传差异统计量KST和Snn以及遗传分化系数FST分别为0.356、0.290和0.561;CMV种群间的基因流Nm为0.200。大多数种群的Tajima’s D、Fu&Li’s D和Fu&Li’s F值为负值,且多数未达显著水平。侵染香蕉的CMV CP基因有氨基酸取代,但未发生明显重组。表明侵染香蕉的CMV具有丰富的遗传多样性,且亚组间的遗传多样性大于亚组内的遗传多样性。
- 饶雪琴吴自林王婉周翎孙洁李华平
- 关键词：香蕉黄瓜花叶病毒基因重组
