李盛文
- 作品数：6 被引量：17H指数：3
- 供职机构：上海海洋大学水产与生命学院更多>>
- 发文基金：国家现代农业产业技术体系建设项目中央级公益性科研院所基本科研业务费专项国家科技支撑计划更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 用微卫星标记鉴定和分析德国镜鲤的家系及遗传结构被引量：1
- 2014年
- 为选育抗疱疹病毒的德国镜鲤(Cyprinus carpio var.mirror carp)新品种,2012年在F1抗病家系基础上,构建27个家系,同池养殖。本研究采集经疱疹病毒感染存活个体,应用多态性微卫星标记对构建的27个德国镜鲤家系进行鉴定和遗传结构分析。结果显示:(1)4个位点累计排除率为99.9%,亲本与子代的配对率为100%(P=0.05);(2)在27个家系的4个位点中检测到32个等位基因,每个位点7~10个等位基因,期望杂合度为0.6796~0.8019,平均期望杂合度为0.7510;(3)8个家系处于Hardy-Weinberg平衡状态下,19个家系处于不平衡状态下(P<0.05),其中有15个家系为极显著不平衡(P<0.01);(4)27个家系间遗传距离为0.1751~0.8772,平均值为0.4425,聚类分析中,27个家系主要聚在两个分支上,其它家系分散于不同分支。结果表明:27个家系具有较高的遗传多样性,家系间遗传分化明显,大部分家系因病毒选择作用偏离Hardy-Weinberg平衡。家系群体遗传结构研究结果将为下一步品种选育工作提供重要的理论依据和技术支持。
- 贾智英李盛文赵新春李池陶葛彦龙石连玉
- 关键词：镜鲤
- 育成品种易捕鲤F_5代保种群体的遗传结构研究被引量：3
- 2016年
- 【目的】研究易捕鲤的群体遗传结构,为其优良性状的稳定保持和种质资源的可持续利用奠定基础。【方法】提取96尾易捕鲤个体的鳍条基因组DNA,以其为模板,利用30对微卫星标记进行PCR扩增,根据基因型,利用生物信息学软件对各种遗传参数进行分析。【结果】在96尾易捕鲤个体中,共检测到154个等位基因,每个位点的等位基因数3～9个,平均有效等位基因数为4.060 7;期望杂合度为0.596 9～0.871 0,平均为0.740 0;多态信息含量为0.628 0～0.855 0,平均为0.702 2,说明此品种具有较丰富的遗传多样性;哈迪-温伯格平衡检验结果表明,群体处于不平衡状态;群体平均固定系数为-0.041 0,说明该群体存在杂合子过剩现象,有较大的选择压力;瓶颈效应分析表明,群体经历了瓶颈效应;根据连锁不平衡方法计算有效群体大小为64.2。【结论】易捕鲤具有较高的遗传异质性和较大的选育空间,但由于人工选择的作用,群体处于不平衡状态,对品种的长期发展极为不利,因而在接下来的工作中应该注重加强保种策略的研究,从而保持其丰富的遗传多样性和优良的经济性状。
- 赵新春贾智英李盛文李池陶石连玉
- 关键词：微卫星保种
- 鲤鱼保种群体遗传结构与感染CyHV-3的转录组研究
- 随着人类对鲤鱼的需求增加，高密度集约化养殖成为了主要养殖方式，但这种养殖方式一旦发病就会出现大规模的感染或死亡，严重影响了鲤鱼产业的健康、稳定和可持续发展。而药物方法除治疗效果甚微外对生态环境也造成污染，因而对鲤感染Cy...
- 李盛文
- 关键词：微卫星保种SNP
- 文献传递
- 散鳞镜鲤两个保种群体的遗传多样性被引量：4
- 2014年
- 利用20个微卫星标记分析国内仅存的两个散鳞镜鲤(Cyprinus carpio)保种群体(SP、CJ)的遗传多样性。结果表明:共检测到147个等位基因,平均值为7.35,有效等位基因数(Ae)、期望杂合度(He)以及多态信息含量(PIC)的平均值分别为2.7828、0.6041和0.5386。SP群体的Ae、He以及PIC值分别为3.1126、0.6479和0.5948,大于CJ群体(2.4529、0.5602和0.4823)。在两个群体中,群体特有等位基因共53个,其中9个为低频等位基因。对20个引物在两个群体中等位基因的显著性分析表明:其中有16个引物可以作为区分两个群体的特异性分子标记。瓶颈效应分析结果显示:2个群体均经历了瓶颈效应。同胞率检测结果(SP97.5%;CJ96.7%)偏高说明群体内近交压力较大。哈迪-温伯格平衡检测表明:两个群体大部分位点偏离平衡并处于杂合子过剩状态。两个群体间的遗传距离(D)为0.5625,SP和CJ群体的个体均各聚为一支。群体间的遗传分化指数(Fst)为0.1138,Nm值为1.9462。该研究表明:散鳞镜鲤群体遗传多样性水平较高,其中SP群体的遗传多样性水平高于CJ群体,两群体处于中度遗传分化。
- 李盛文贾智英柏盈盈李池陶石连玉
- 关键词：散鳞镜鲤微卫星亲缘关系
- 松浦红镜鲤保种群体的遗传结构被引量：11
- 2014年
- 应用35对多态性较高的微卫星标记对鲤新品种——松浦红镜鲤（Cyprinuscarpiovar.songpuredmirrorcarpl的保种群体进行了遗传结构研究。结果显示，在91尾松浦红镜鲤个体中，共检测到140个等位基因，每个位点等位基因数3-6个，平均有效等位基因数为3．0426；期望杂合度范围为0．3750-0．8274，均值为0．6493；多态信息含量范围为0．396-0．912，均值为O．5869；哈迪-温伯格平衡检验结果表明群体处于不平衡状态；平均固定系数为-0．026，说明该群体存在杂合子过剩现象；瓶颈效应分析表明，群体已经历了瓶颈效应；根据连锁不平衡方法计算有效群体大小为31．2。该研究表明松浦红镜鲤遗传多样性较为丰富，为了在下一步保种工作中避免或降低瓶颈效应，应加强保护工作，从而保持其丰富遗传多样性和优良的经济性状。
- 李盛文贾智英柏盈盈李池陶石连玉
- 关键词：微卫星群体遗传结构保种
- 与鲤鱼免疫相关的遗传标记
- 与鲤鱼免疫相关的遗传标记，它涉及鲤鱼的遗传标记。本发明提供与鲤鱼免疫相关的SNP遗传标记为鲤鱼抗病选育提供充足的标记。与鲤鱼免疫相关的遗传标记DNA序列如SEQ ID NO：1～10所示。本发明可用于水产生物工程领域。
- 贾智英徐鹏石连玉李池陶许建李炯堂李盛文柏盈盈张晓峰孙效文胡雪松
- 文献传递
