余波澜
- 作品数:35 被引量:147H指数:6
- 供职机构:广州医科大学更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金广州市科技计划项目广州市科技攻关项目更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学环境科学与工程自动化与计算机技术更多>>
- Logistic回归法和机器学习算法构建子痫前期预测模型的比较
- 2024年
- 目的利用医院电子病历系统首页信息和临床检验数据通过logistic回归(logistic regression,LR)法和机器学习算法构建子痫前期(preeclampsia,PE)预测模型,同时比较机器学习算法和LR构建模型的预测性能。方法基于2012年1月1日至2019年12月31日在广州医科大学附属第三医院就诊孕产妇的围产期数据和柔济妊娠检验数据库信息,根据临床诊疗指南和相关文献报道关联整合后选取数据量较为完整的孕24~28周共2736例孕妇的28项临床相关指标作为PE预测模型构建数据。将其中PE患者作为PE组(n=245),其余非PE患者中采用欠采样法选择255例为对照组。使用随机森林算法(random forest,RF)及极端梯度上升算法(eXtreme Gradient Boosting,XGB)和LR模型分别构建PE疾病预测模型。模型构建完成后,在2019年6月至2022年12月开展的PE前瞻性队列研究获得数据中(PE组38例,对照组80例),进行PE预测准确性的外部验证。采用准确度、灵敏度、特异度、受试者工作特征曲线下面积比较不同模型的预测效能。结果3种预测模型构建时纳入的指标提示,尿酸、肌酐、年龄、孕早期体重指数、尿素、甘油三酯、红细胞计数、嗜酸性粒细胞计数、总胆固醇、中性粒细胞计数、尿蛋白、丙氨酸氨基转移酶以及尿潜血是影响PE预测模型的指标。RF、XGB和LR模型在训练集和测试集中的受试者工作特征曲线下面积分别为0.851(95%CI:0.730~0.891)、0.955(95%CI:0.865~0.987)、0.884(95%CI:0.767~0.923)和0.845(95%CI:0.723~0.868)、0.907(95%CI:0.791~0.919)、0.851(95%CI:0.755~0.893)。在测试集中,RF、XGB和LR模型的准确度、灵敏度与特异度分别为0.803、0.607、0.958,0.864、0.790、0.927和0.832、0.661、0.971。在外部验证集中RF、XGB和LR预测模型的准确度分别为0.822、0.814和0.763;灵敏度分别为0.737、0.789和0.605;特异度分别为0.863、0.825和0.838,其中XGB模型的约登指数最高,为0.614。结论相对于
- 许兴能陈胜柱周嘉怡杨思王旭薇余波澜
- 关键词:子痫前期LOGISTIC回归模型
- 去甲阿佐昔芬与谷胱甘肽的结合及其对谷胱甘肽转移酶的抑制作用被引量:3
- 2013年
- 目的探讨阿佐昔芬代谢产物去甲阿佐昔芬与谷胱甘肽及谷胱甘肽转移酶的相互作用。方法SD大鼠ip注射去甲阿佐昔芬10mg·kg-1溶液,每天1次,连续3d,第4天处死大鼠,提取肝内去甲阿佐昔芬与谷胱甘肽结合产物,利用高效液相色谱-质谱分析比较和鉴定去甲阿佐昔芬在肝微粒体和大鼠肝内的谷胱甘肽结合产物。雷洛昔芬20μmol·L-1,4-羟基他莫昔芬20μmol·L-1和去甲阿佐昔芬20μmol·L-1分别加入大鼠肝微粒体系中孵育30min后,应用试剂盒测定谷胱甘肽转移酶活性,考察其对谷胱甘肽转移酶的体外抑制作用,并测定了去甲阿佐昔芬0,5,10,20和30μmol·L-1对谷胱甘肽转移酶的抑制强度。结果体内实验表明,去甲阿佐昔芬代谢产物可在大鼠肝中形成谷胱甘肽结合物。质谱分析鉴定其主要成分为去甲阿佐昔芬双醌甲基化合物与谷胱甘肽的单价结合物。体外的酶活性测定表明,去甲阿佐昔芬能浓度依赖地抑制谷胱甘肽转移酶活性,去甲阿佐昔芬20μmol·L-1可以抑制谷胱甘肽转移酶90%以上的活性。与雷洛昔芬和4-羟基他莫昔芬相比,去甲阿佐昔芬是最强的抑制剂,在相同浓度下,其抑制率显著高于雷洛昔芬和4-羟基他莫昔芬(P<0.01)。结论阿佐昔芬的代谢产物具有较强的反应性,可能会与生物分子中的巯基发生共价结合。其在临床上的长期生物学效应值得进一步探讨。
- 余波澜郭小桥司沙沙
- 关键词:醌类谷胱甘肽转移酶
- 新型肝癌组织的体外三维培养模型
- 2020年
- 目的:利用肝癌组织进行体外的三维(three-dimension,3D)组织块培养,通过添加PD98059和霍乱毒素(cholera toxin,CT)优化培养条件,建立一种高活性的肝癌组织体外培养模型。方法:收集中山大学肿瘤防治中心肝胆科的肝癌组织标本,经清洗、冻存、复苏等处理后分为对照组、PD组、CT组、PD+CT组,同时进行体外的二维(two-dimension,2D)和三维培养。各组组织采用DNA断裂的原位末端标记法(TUNEL)检测组织细胞凋亡情况,qRT-PCR检测BCL-2、BID、Caspase 3、Cyclin D1、CDK2、ELK-1、C-FOS、C-MYC、C-JUN等相关基因的mRNA表达水平,免疫荧光染色检测BCL-2和cleaved caspase-3蛋白表达情况,筛选并确定最优的体外培养方法。结果:3D培养组的组织细胞凋亡均少于2D培养组;PD98059通过上调BCL-2蛋白的表达,下调cleaved caspase-3蛋白的表达,激活MEK/ERK下游基因,从而减少体外培养的组织细胞凋亡,增强其抗凋亡能力;霍乱毒素通过上调Cyclin D1、CDK2的基因表达,促进其增殖。结论:我们开发了一种新型肝癌组织的体外三维培养模型,它可以作为进一步的药物试验和人源性异种移植(PDX)模型的工具。
- 尹萌陈焕鹏李永超郭荣平林小军刘忠华余波澜黄朝峰赵擎宇
- 关键词:肝细胞癌PD98059霍乱毒素
- 以4种基因诱导产前诊断绒毛细胞建立诱导性多能干细胞被引量:1
- 2013年
- 背景:诱导性多能干细胞因具有多能性特征,可以诱导分化为特定的细胞,包括神经细胞、造血细胞等。目的:建立产前诊断绒毛细胞来源的诱导性多能干细胞。方法:运用反转录病毒介导4种基因hOct4、hSox2、hc-Myc、hKlf4诱导产前诊断绒毛细胞,对建立的诱导性多能干细胞进行多能性、体内外分化能力、核型等鉴定。结果与结论:建立的诱导性多能干细胞能维持自我更新状态,在蛋白和mRNA水平上高表达全能性的标志基因,具有体内、外分化潜能;在体外长期培养能维持正常核型。说明4种全能性基因转入绒毛细胞可获得具有多能性的诱导性多能干细胞,这为胎儿的细胞自体移植治疗提供理想来源,为产前诊断疾病机制研究提供很好的细胞模型。
- 骆玉梅范勇陈欣洁岳磊黎青余波澜何文智马晓燕孙筱放
- 关键词:干细胞诱导性多能干细胞绒毛细胞产前诊断
- 精子核蛋白组型异常及DNA损伤与精子活动力的相关性研究被引量:6
- 2013年
- 目的探讨精子核蛋白组型异常,精子DNA完整性与精子活动力的相关性。方法选取生殖医学中心进行常规精液分析的人群,其中173例为正常对照、144例低精子活力患者作为研究对象。通过苯胺蓝染色法检测其精子核蛋白组型转换,染色质扩散法检测精子完整性并分析三者之间的相关性。结果低精子活力组的核蛋白组型转换异常率[(23.9±9.4)%vs.(17.5±8.1)%]、DNA碎片指数[(19.4±8.5)%vs.(13.5±5.8)%]显著高于正常对照组(P均<0.01)。精子核蛋白组型转换异常率与DNA碎片指数呈线性相关,Pearson相关系数为0.298(P<0.01)。结论低精子活力患者的核蛋白组型转换异常率、DNA碎片指数显著增高,同时精子核蛋白组型异常与DNA损伤具有显著相关性。
- 陈康周宇林余波澜高兴成
- 关键词:精子能动性DNA完整性
- 去甲阿佐昔芬与谷胱甘肽的结合及其对谷胱甘肽转移酶的抑制作用
- 目的探讨阿佐昔芬代谢产物去甲阿佐昔芬与谷胱甘肽及谷胱甘肽转移酶的相互作用。方法 SD大鼠ip注射去甲阿佐昔芬10 mg·kg溶液,每天1次,连续3 d,第4天处死大鼠,提取肝内去甲阿佐昔芬与谷胱甘肽结合产物,利用高效液相...
- 余波澜郭小桥司沙沙
- 关键词:醌类谷胱甘肽转移酶
- 文献传递
- 围孕期补充叶酸对不良妊娠结局的影响被引量:21
- 2017年
- 叶酸(FA)最初被认为可以治疗贫血而进入临床使用,随后发现,孕早期补充叶酸可以有效降低胚胎神经管畸形(NTDs)、子痫前期等妊娠期并发症的发生率。本文综述了孕期女性叶酸的补充与不良妊娠结局的相关研究进展。
- 许培余波澜陈敦金
- 关键词:叶酸妊娠期女性妊娠期并发症
- 父源性效应影响后代代谢的研究进展被引量:1
- 2019年
- 代谢性疾病与遗传和环境因素相关,母源性效应诱导代谢紊乱已得到国内外大量研究证实。父源性效应影响后代代谢的方式包括父本饮食营养改变因素、父本糖代谢异常因素、父本非饮食营养改变体质量、父本心理因素、父本暴露有害环境因素,其代谢特征跨代传递由精子、精子携带的RNAs、精子tRNA、精子miRNA为载体,影响胎儿代谢紊乱的表观遗传机制主要包括DNA修饰、组蛋白修饰和非编码RNA的表达等。
- 刘桂红黄珺吴逊伟戴莉娟周嘉怡余波澜
- 关键词:表观遗传
- 子痫前期孕妇外周血游离DNA的研究进展被引量:4
- 2020年
- 妊娠高血压疾病,尤其是子痫前期(PE),是世界范围内孕产妇和围产期发病率和病死率增加的主要原因之一。而孕妇血液胎儿游离的DNA(cff-DNA)可作为早期预测PE的发生发展。并且总结分析cff-DNA与PE的相关性及其可能存在的机制,进一步说明PE的发生可能与DNA甲基化相关,同时探讨其作为生物标志物的局限性,为有效预测子痫前期提供参考。
- 周嘉怡吴逊伟戴莉娟赵瑰丽余波澜
- 关键词:子痫前期生物标志物
- 精子中DNA甲基化修饰研究进展被引量:5
- 2014年
- DNA甲基化是表观遗传学的重要内容之一,精子在发生过程中经历了甲基化和去甲基化过程,精子DNA甲基化修饰的稳定性依赖于鱼精蛋白,不育男性精液质量的降低与精子基因组甲基化水平改变有关,但目前大家研究基因位点多而杂,这些位点甲基化模式的改变是否有相互联系尚不清楚,研究热点集中在某一些生精相关的印记基因的甲基化水平改变比较多,但其机制仍然模糊,精子DNA甲基化修饰改变是否影响辅助生殖结果目前也有争论,各种理化环境因素对精子中DNA甲基化修饰影响已被越来越多的研究者发现,但具体机制有待进一步研究。
- 刘丹王芳孙筱放余波澜
- 关键词:表观遗传学男性不育精液质量