周燕妮 作品数:5 被引量:12 H指数:3 供职机构: 北京林业大学林学院森林培育与保护教育部重点实验室 更多>> 发文基金: 国家自然科学基金 国家科技重大专项 更多>> 相关领域: 生物学 农业科学 更多>>
青杄SWEET1蛋白编码基因参与花粉萌发和逆境响应过程 SWEETs糖转运蛋白家族是近几年新发现的一个蛋白家族,它们广泛的分布于真核生物以及原核生物中,SWEETs糖转运蛋白可对多种单糖以及蔗糖进行运输,因此能参与植物中包括植物防御以及花粉发育过程中碳水化合物的供应等多种生理... 周燕妮关键词:编码基因 花粉萌发 花粉管生长 逆境响应 青杄类伸展蛋白基因PwELP1的克隆及表达分析 2016年 【目的】克隆青杄类伸展蛋白(extensin-like proteins,ELPs)基因PwELP1并分析该基因的表达特性,为研究ELP基因家族的功能奠定基础。【方法】以青杄cDNA文库为模板,用RACE-PCR方法克隆青杄类伸展蛋白编码基因PwELP1的cDNA全长,利用DNAMAN确定PwELP1的编码框及蛋白氨基酸的翻译,运用clustalx软件与Espript工具进行多序列比对,利用MEGA 5软件的邻位相连法构建系统树,并对编码蛋白进行生物信息学分析;利用RT-qPCR检测PwELP1基因在青杄不同组织中表达的特异性、花粉和种子不同萌发时期及幼苗受到不同逆境处理时的表达差异,分析该基因的组织发育及逆境响应表达特点。【结果】PwELP1基因全长832bp,其编码一个由159个氨基酸组成的蛋白,该蛋白的N端与C端均有比较保守的结构域;此蛋白二级结构由1个α-螺旋、5个β-折叠与3个β-转角结构构成,对其三级结构的预测印证了这一结果,同时发现该蛋白中还存在部分无规则卷曲。其分子质量为17.03ku,理论等电点为5.81。PwELP1在青杄花粉中的表达量较高,且在花粉萌发后期(30-36h)以及种子萌发初期(第2天)表达量高;PwELP1的表达不同程度地受低温、高温、茉莉酸甲酯(MeJA)、H2O2、脱水以及脱落酸(ABA)等非生物逆境胁迫处理的诱导,尤其是H2O2、高温和ABA,处理初期表达量就显著升高。【结论】PwELP1在青杄花粉和种子萌发过程中可能发挥重要功能,并可参与青杄对非生物逆境胁迫的响应过程。 郜银涛 周燕妮 罗朝兵 张凌云 陈坤明关键词:非生物胁迫 青杄PwUSP2基因的克隆和表达分析 被引量:6 2015年 广泛逆境胁迫蛋白(USPs)参与碳缺乏、缺氧、干旱和高盐等多种非生物胁迫,但在植物中的研究尚不深入。本文通过RACE-PCR的方法获得青杄PwUSP2基因的c DNA全长,共987bp,其中编码区723 bp,共编码240个氨基酸。利用生物信息学工具对其理化性质、二级结构和三级结构进行分析,结果显示,该蛋白理论分子质量为26.84 kDa,理论等电点为4.61,有丝氨酸和苏氨酸结合位点,为非跨膜的亲水蛋白。PwUSP2具有USP家族典型的Usp A结构域,但无典型的ATP结合位点G-2X-G-9X-G[S/T]。RT-qPCR分析表明,PwUSP2在青杄花粉、果实、种子、成熟叶、幼叶、成茎中均有表达,在果实中表达量较高。同时,PwUSP2在脱落酸(ABA)、茉莉酸甲酯(MeJA)等非生物胁迫下表达量有明显变化,推测PwUSP2可能参与青杄对逆境胁迫的响应。 周燕妮 李艳芳 张通 张凌云关键词:胁迫响应 青杄生长素抑制蛋白基因PwARP-1的克隆及表达分析 被引量:3 2014年 从青杄的cDNA文库中筛选出一个生长素抑制蛋白基因PwARP-1(Auxin-repressed protein 1),并通过RACE-PCR技术获得PwARP-1 cDNA全长。生物信息学分析显示,PwARP-1基因编码155个氨基酸残基的蛋白,分子量为17.1 kD,理论等电点为10.07,富含无规则卷曲。以多年生青杄和青杄幼苗为研究材料,通过RT-qPCR技术检测PwARP-1的组织特异性表达、激素的响应模式及种子萌发过程中的表达量模式。结果表明,PwARP-1在青杄各个组织中均有表达,在花粉中表达量最高,在种子中的表达量最低。PwARP-1在种子萌发过程中表达量呈先上升,在第10天表达量达到最高后开始下降。进一步试验表明,PwARP-1能响应多种逆境胁迫和激素处理。在赤霉素(GA)和生长素(IAA)处理下PwARP-1的表达量被抑制。在干旱胁迫和油菜素内酯(BR)激素处理下PwARP-1的表达量逐渐升高,而在在盐胁迫、茉莉酸甲酯(MeJA)和脱落酸(ABA)等激素处理下PwARP-1的表达量先下降后上升。这些结果显示PwARP-1可能参与了植物种子萌发、多种逆境胁迫和激素响应过程。 孙帆 罗朝兵 周燕妮 张凌云关键词:植物激素 青杄PwWrbA基因克隆及表达分析 被引量:1 2014年 色氨酸阻遏结合蛋白(tryptophan repressor-binding protein,WrbA)是一种重要的抗氧化酶类,参与了多种逆境反应。笔者通过RACE-PCR的方法克隆得到青杄WrbA基因的cDNA全长,共1 045 bp,编码区651 bp,编码203个氨基酸。利用生物信息学工具对其进行理化性质、二级结构和三级结构的分析,该蛋白理论分子质量21.80 ku,pI值6.43,N端11—15位氨基酸和C端112—165位氨基酸是FMN结合位点。荧光定量PCR和半定量RT-PCR发现青杄PwWrbA在各组织中都有表达,但在针叶中表达量最高。同时,PwWrbA在NaCl和ABA胁迫处理后表达量升高,H2O2也会影响其表达的改变,H2O2处理6 h后表达量上调。因此,PwWrbA是一个新的WrbA基因,推测其可能在青杄逆境胁迫应答中发挥作用。 张通 周燕妮 李长江 张凌云关键词:生物信息学 胁迫响应