刘晓蕾
- 作品数：17 被引量：80H指数：5
- 供职机构：长沙市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：湖南省自然科学基金湖南省卫生厅科技项目湖南省卫生厅科研基金更多>>
- 相关领域：医药卫生经济管理更多>>
- 2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒HA、NA及NS基因进化分析被引量：4
- 2017年
- 目的分析2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)血凝素(Hemagglutinin,HA)、神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)及非结构蛋白(Non-structural,NS)基因进化特征。方法从2014年长沙市活禽市场采集501份环境标本,利用Real-time PCR方法进行A型、H5、H7和H9亚型流感病毒核酸检测,并对单一H5阳性标本进行核苷酸测序,病毒HA、NA和NS基因测序结果进行在线BLAST分析,利用Mega5和Bioedit软件构建核苷酸进化树和氨基酸(Amino acids,aa)比对。结果从501份环境标本中检出A型H5亚型病毒阳性标本177份(检出率35.33%),其中8份标本经核苷酸测序鉴定为H5N1亚型病毒,进化分析表明大部分H5N1病毒HA基因位于2.3.2分支内,聚集形成一个新亚分支,NA及NS基因位于2.3.2.1b亚分支。HA蛋白受体结合位点aa为QSG,表现为禽流感病毒受体特征;NA蛋白未出现H275Y及N295Saa替换,对神经氨酸酶抑制剂敏感;HA、NA及NS蛋白关键分子位点表现为高致病性的分子特征。结论 2014年长沙市活禽市场污水中H5N1亚型禽流感病毒HA、NA和NS基因表现为高致病性的分子特征,但不具有对人易感的受体特征,需要进一步监测。
- 张如胜孙边成姚栋叶文陈静芳黄政刘晓蕾欧新华陈发明
- 关键词：活禽市场禽流感病毒H5N1亚型基因
- 2013—2018年长沙市流感病原学监测结果分析被引量：2
- 2021年
- 目的分析2013—2018年长沙市流行性感冒(流感)病例的病原学监测数据,了解长沙市流感活动水平和流行趋势,为流感防控提供科学依据。方法采用SPSS 13.0统计软件对2013—2018年长沙市哨点医院流感样病例(influenza-like illness,ILI)的病原学监测数据进行统计分析。结果2013—2018年长沙市共检测流感样病例咽拭子标本10602份,通过流感病毒分离培养出881株毒株,阳性率为8.3%,两家哨点医院采样阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=15.17,P<0.05)。其中H1N1亚型毒株占25.2%、H3N2亚型毒株占32.6%、B型Yamagata系(BY)毒株占25.8%、B型Victoria系(BV)毒株占16.5%。男性流感病毒分离阳性率(8.3%)稍低于女性(8.4%),差异无统计学意义(χ^(2)=0.029,P>0.05)。0~<5岁组流感病毒分离阳性率最高,为16.3%,60岁以上组分离阳性率最低,仅1.1%,不同年龄组检测阳性率差异有统计学意义(χ^(2)=388.03,P<0.05)。结论2013—2018年长沙市季节性流感的流行有冬春和夏季两个高峰,高峰时间持续2~3个月,各亚型流感交替成为优势型别。应持续开展流感监测,并加强婴幼儿和老年人疫苗接种。
- 刘晓蕾袁洁叶文裴瑞青欧新华徐明忠
- 关键词：流行性感冒流感样病例病原学监测咽拭子流感疫苗
- MALDI-TOF MS用于沙门菌食源性疾病暴发同源性分析初步研究
- 2023年
- 目的评价基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱(matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry,MALDI-TOF MS)技术用于沙门菌食源性疾病暴发同源性分析的效果,为沙门菌暴发疫情处置提供技术支持。方法收集长沙市近年5起食源性疾病暴发事件相关的42株沙门菌,进行生化鉴定和血清学分型并对其进行脉冲场凝胶电泳(pulsed-field gel electrophoresis,PFGE)分型分析。应用MALDI-TOF MS技术采集42株沙门菌质谱数据构建主要谱图后进行质谱鉴定,并对42株沙门菌进行相关距离聚类同源分析,再对不同事件的相关沙门菌分4次分别进行不加参考菌株和加入参考菌株的聚类同源分析,并与PFGE聚类分析结果进行比较。结果29份食品中分离出5株沙门菌,62份病人标本中分离出37株沙门菌,42株沙门菌的质谱鉴定结果和生化鉴定结果符合率为100%,血清学鉴定分为3个血清型,肠炎沙门菌22株,布伦登卢普沙门菌17株,鼠伤寒沙门菌3株。PFGE将5次事件的沙门菌分成了4个内部完全一致的分支,42株沙门菌的质谱聚类在300的相对相关距离水平上分为3个不同的分支,和血清学分型一致,和PFGE聚类分型大致相同。4次无参考菌株的质谱分别聚类同源分析不能将相关菌株聚类为预期的簇,但加入参考菌株后的质谱聚类同源分析能将同一事件中的菌株聚类成相似度接近100%的一簇,和PFGE分型结果高度一致。结论MALDI-TOF MS聚类分析可在一定范围内应用于沙门菌食源性疾病暴发同源性的病原学确认,可作为PFGE同源性分析的一种较好补充方法,但其不能直接将不同平台数据进行比较。
- 苏良宋迎春杨柳青张玉娟刘晓蕾
- 关键词：沙门菌基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱脉冲场凝胶电泳聚类分析食源性疾病
- 2014年长沙市禽类场所环境H9N2亚型禽流感病毒分子流行特征分析被引量：8
- 2017年
- 目的了解2014年长沙市禽类场所环境中H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)血凝素(Hemagglutinin,HA)、神经氨酸酶(Neuraminidase,NA)和非结构蛋白(ron-structural,NS)基因的分子进化特征,为人感染H9N2亚型AIV防控提供实验室科学证据支持。方法对2014年长沙市禽类场所中采集的501份环境标本(禽类饮水263份,污水221份,其他标本17份)利用real-time PCR方法进行A型、H5、H7和H9亚型流感病毒核酸检测,然后对单独H9阳性标本利用HA和NA基因通用引物进行RT-PCR扩增和核苷酸测序,病毒HA、NA及NS基因测序结果在线BLAST分析,利用Bioedit和Mega5软件进行氨基酸比对和进化树构建。结果从501份环境标本中检出A型AIV核酸阳性标本350份,H9亚型核酸阳性标本191份,占总标本数量的38.12%,H5亚型核酸阳性标本177份(35.33%),H7亚型核酸阳性11份(2.20%),H5和H9亚型混合核酸阳性标本68份(13.57%)。部分单独H9亚型核酸阳性标本经RT-PCR和核苷酸测序鉴定出阳性H9N2亚型病毒核酸标本23份,分子进化分析表明2014年长沙市禽类场所环境中的绝大部分H9N2亚型AIV HA、NA、NS基因来源于A/Chicken/Shanghai/F/98(F98)类似株病毒,属于新的S基因型,HA蛋白受体结合位点(Receptor binding site,RBS)第235位(对应H3流感第226位)氨基酸为Leu(L),表现为特异性结合人流感病毒受体特征,病毒HA、NA及NS蛋白关键分子位点表现为低致病性的分子特征。结论 2014年长沙市禽类场所环境中H9亚型AIV核酸阳性率最高,H9N2亚型AIV的HA、NA和NS基因表现为低致病性的分子特征,但具有容易感染人类的特征,需要进一步加强监测。
- 张如胜姚栋叶文陈静芳黄政刘晓蕾陈田木欧新华孙边成
- 关键词：禽流感病毒H9N2亚型进化分析
- 长沙市首例人感染H9N2禽流感病毒的HA基因序列特征分析被引量：1
- 2016年
- 目的对长沙市首例人源H9N2禽流感病毒进行病毒分离与HA基因特征序列分析。方法用细胞培养法在可疑病例标本中分离H9N2禽流感病毒毒株,RT-PCR方法扩增禽流感病毒HA基因全长并测序,对所得结果进行氨基酸同源性与进化树分析。结果分离的毒株命名为A/Hunan/44558/2015,GenBank登录号为KX595338。毒株存在2处新发突变位点,HAT197D、HAD483N,第313位出现与湖南省人源H9N2毒株A/Lengshuitan/11197/2013相同的糖基化位点NCS。与A/Wild Chicken/Shanghai/C1/2014和A/Environment/Hunan/28028/2014的同源性分别为97.9%和97.6%。进化树分析分离的毒株处于Y280分支。结论发现病毒2处新的基因突变位点,与2014年湖南省环境源毒株同源性较高,存在基因交换重组,从分子水平揭示病毒HA基因的进化趋势。
- 黄政欧新华袁洁刘晓蕾
- 关键词：禽流感H9N2血细胞凝集素
- 2017年—2021年长沙市游泳池水微生物监测结果分析被引量：2
- 2022年
- 目的 了解长沙市游泳池卫生状况,为改善游泳池水质卫生提供科学依据。方法 据国家标准方法检测2017年—2021年长沙市游泳池水的菌落总数和大肠菌群,并对结果进行统计分析。结果 在2017年—2021年的游泳池水微生物监测结果中,水样共151份,总合格率为76.82%,其中细菌总数合格率为76.82%,大肠菌群合格率为99.34%,不同年份、不同月份合格率差异均无统计学意义(P> 0.05)。按不同区县进行分类比较,3个区县高于长沙市合格率,5个区县低于长沙市合格率,合格率最高的是望城区,合格率最低的是雨花区和高新区,差异有统计学意义(χ~2=16.12,P<0.05)。结论 长沙市近5年游泳池水的微生物污染情况未有效改善,需要进一步努力,做好监测依然是一件长期而艰巨的工作。
- 张玉娟袁洁叶文张福生刘晓蕾张劲夫
- 关键词：游泳池水细菌总数大肠菌群监测分析
- 2015—2019年长沙市食源性疾病沙门菌血清分型和耐药情况分析被引量：11
- 2022年
- 目的了解长沙市食源性疾病沙门菌血清型分布和耐药情况,为本地区食源性沙门菌病诊断和治疗提供依据。方法按照国家《食源性疾病监测工作方案》要求,将2015—2019年收集到的2299份食源性疾病粪便标本进行沙门菌分离鉴定和血清分型,药敏试验分析耐药情况。结果沙门菌检出率为9.57%(220/2299),5年间检出率无差异。发病集中于夏秋季。血清型共有21种,鼠伤寒沙门菌最多,占62.27%(137/220),其次为肠炎沙门菌占19.09%(42/220)。220株沙门菌整体耐药率为91.82%;耐药前四位抗生素是氨苄青霉素82.27%,四环素71.36%,氨苄西林/舒巴坦65.45%和头孢唑啉57.27%;敏感的抗生素前三位是亚胺培南、阿奇霉素和头孢西丁,耐药率分别为0.00%、4.09%和4.55%;多重耐药率为72.27%(159/220)。结论长沙地区食源性沙门菌感染夏秋季节多发,主要血清型为鼠伤寒沙门菌和肠炎沙门菌,存在严重多重耐药,应加强耐药监测,临床治疗应选择较敏感的抗生素。
- 苏良杨柳青宋迎春刘晓蕾贾华云陈帅
- 关键词：食源性疾病沙门菌血清型耐药
- 活禽市场为人H9N2亚型禽流感感染来源的研究
- 目的 探讨人H9N2亚型禽流感病毒(Avian influenza virus,AIV)的感染来源,为人感染H9N2亚型AIV疫情防控提供依据.方法 对2014～2015年长沙市活禽市场环境开展AIV核酸监测,收集全球人...
- 张如胜黄政刘晓蕾姚栋陈静芳袁洁欧新华孙边成
- 关键词：新发传染病H9N2禽流感病毒活禽市场
- 长沙市2013-2014年麻疹野毒株与疫苗株的快速鉴定与分析被引量：4
- 2016年
- 目的了解2013-2014年长沙地区是否存在疫苗株感染,建立实验室快速鉴别麻疹野毒株与疫苗株方法。方法按照《全国麻疹监测方案》,采集麻疹疑似病例咽拭子标本,应用RT-PCR方法进行麻疹病毒核酸检测,再从麻疹病毒核酸阳性病例的咽拭子标本中提取核酸,采用转录-聚合酶链反应-限制性片段长度多态性分析(reverse transcription-polymerase chain reaction-restriction fragment length polymorphism,RT-PCR-RFLP)方法进行疫苗株和野毒株的快速鉴定和基因序列分析。结果共采集到697份麻疹疑似病例的咽拭子标本,检出224份麻疹病毒核酸阳性,9例出现麻疹临床症状的患者有麻疹减毒活疫苗(measles attenuated live vaccine,MV)接种史。经RT-PCR-RFLP方法鉴定,均为野毒株感染。测序及序列比对分析结果显示均为H1a基因型。结论 2013-2014年长沙麻疹疑似症状者及9例MV接种史患者均为野毒株感染。成功建立RT-PCR-RFLP方法区别疫苗株与野毒株的感染。
- 叶文孙边成陈发明欧新华张如胜黄政刘晓蕾
- 关键词：麻疹野毒株疫苗株
- 长沙市活禽市场人H9N2亚型禽流感感染来源的研究被引量：5
- 2019年
- 目的探讨人H9N2亚型禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)的感染来源。方法对2014-2015年长沙市活禽市场环境开展AIV核酸监测,收集全球人感染H9N2 AIV病例数据,利用MEGA 6软件对全球人感染H9N2 AIV、活禽市场环境H9N2 AIV和部分禽H9N2 AIV血凝素(hemagglutinin,HA)、神经氨酸酶(neuraminidase,NA)及非结构蛋白(nonstructural protein,NS)基因进行进化分析。结果 2014-2015年长沙市活禽市场环境中H9 AIV的核酸阳性率最高(占44.76%),污染较为严重。全球共报告27例人感染H9N2 AIV病例,绝大多数病例经治疗后康复,流行病学调查显示59.26%(16/27)的病例明确有禽类或活禽市场暴露史。HA、NA及NS进化分析显示2013-2016年分离自湖南、广东的人源H9N2 AIV分离株与湖南和广东辖区活禽市场环境中分离到的H9N2 AIV亲缘关系近,核苷酸相似性高达97%~99%。结论活禽市场是人H9N2 AIV的感染来源之一。
- 张如胜黄政刘晓蕾姚栋陈静芳袁洁欧新华孙边成
- 关键词：新发传染病H9N2活禽市场
