张荣秋
- 作品数：13 被引量：43H指数：4
- 供职机构：厦门市疾病预防控制中心更多>>
- 发文基金：福建省科技厅自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 厦门市实施“14+7隔离”与“核酸+总抗体筛查”策略对发现境外输入性新型冠状病毒感染者的作用分析被引量：5
- 2021年
- 目的评估厦门市实施入境人员“14+7隔离”与“核酸+总抗体筛查”策略(联合筛查策略)对发现境外输入性新型冠状病毒(新冠病毒)感染者的作用。方法研究对象为2020年3月17日至12月31日厦门市入境人员、7月18日至12月31日外地隔离不足21 d的入境人员。收集和分析实施联合筛查策略后的境外输入性新型冠状病毒感染者的发现时间、路径和检测情况。结果在174628名入境人员和943名外地入境人员中,共发现304例境外输入性新冠病毒感染者,其中163例(53.6%)为总抗体阳性后经多次及多部位核酸检测确诊,27例(8.9%)在入境14 d后首次核酸阳性,136例入境“14 d”隔离期间首次核酸检测阳性,仅8例在总抗体阳性后首次核酸检测阳性,128例在平均2.3次(最高6次)核酸检测阴性后转为阳性。联合筛查策略比“14 d隔离+核酸筛查”策略估算多检出155例,占入境感染者总数的51.0%,提高检出率约1倍。截至2021年2月26日尚未发现厦门市入境人员引起的续发感染。结论厦门市对入境人员实施联合筛查策略,可有效筛查入境14 d后转为核酸阳性的新冠病毒感染者,与“14 d隔离+核酸筛查”策略相比,有效提高检出率,降低境外输入引起续发传播的风险。
- 沈理通段振华陈泽辉杨天赐林涛张荣秋蒋丽娜曾小红温慧欣詹钦勇苏迎盈张雅丽彭质斌郑建东郑蓉蓉秦颖袁权陈长荣
- 关键词：抗体
- 厦门市境外输入新冠病毒奥密克戎变异株基因组特征分析
- 2023年
- 目的 分析厦门市输入性新冠病毒奥密克戎(Omicron)变异株的基因组序列特征,为防控境外输入性Omicron变异株引起的本土疫情提供理论依据。方法 采集厦门市2021年12月—2022年2月输入的144例新冠肺炎病例鼻拭子样本,用二代测序技术进行新冠病毒基因组测序,对获取的全基因组序列进行变异位点检测,并基于邻接法用Mega软件构建进化树。结果 去除低质量序列后,共获得119例病例的组装完整的病毒基因组序列,1×覆盖度99.3%~99.6%。Pangolin分型显示,共鉴定出17个Omicron变异型,包括11个BA.1及其分支,6个BA.2及其分支。共发现149个核苷酸突变位点,71个新发氨基酸突变位点:其中ORF1ab区50个、S蛋白区4个、ORF3a区6个、ORF7a区2个、ORF8区2个、N蛋白区7个。在S蛋白的受体结合域关键位点上未发现变异。结论 在Omicron变异株流行初期,揭示了厦门市输入性Omicron变异株病毒序列的基因组变异特征,为持续监测新冠病毒基因组变异奠定了基础。
- 陈泽辉曾小红张荣秋张建梅邱汉泉
- 关键词：输入性病例基因组变异
- 厦门市新发现HIV-1感染者病毒载量及外周血T淋巴细胞检测分析被引量：10
- 2020年
- 目的了解厦门市新发现人类免疫缺陷病毒-1(HIV-1)感染者的血浆HIV病毒载量及外周血T淋巴细胞基线情况,探讨病毒载量与外周血T淋巴细胞数量的相关性。方法采用罗氏COBAS TaqMan 48病毒载量仪和贝克曼FC500流式细胞仪检测269例新确证HIV-1感染者的血浆HIV病毒载量和外周血T淋巴细胞,应用SPSS 20软件对检测数据进行分析。结果93.69%(252/269)样本的病毒载量≥103拷贝/mL,病毒载量检测结果为23~1.76×10^6拷贝/mL,对数平均值为(4.43±0.79)log/mL;不同性别、年龄、婚姻状况、文化程度、传播途径的新发现HIV-1感染者的病毒载量水平构成情况比较,差别无统计学意义(P>0.05);血浆病毒载量对数值与CD3^+T淋巴细胞总数、CD8^+细胞计数无显著相关性,但与CD4^+细胞数量和CD4^+/CD8^+比值总体呈负相关[r分别为-0.276(P<0.01)和-0.355(P<0.01)]。结论厦门市大部分新发现的HIV-1感染者体内HIV病毒复制活跃,应考虑联合应用病毒载量和外周血T淋巴细胞基线检测结果指导抗病毒治疗和观测抗病毒治疗效果。
- 李莉张荣秋马桂林欧阳雪
- 关键词：HIV-1病毒载量T淋巴细胞
- HIV-1抗体不确定患者追踪随访及其病毒载量分析被引量：5
- 2020年
- 目的分析2017-2018年厦门市1型艾滋病病毒(HIV-1)抗体不确定病例的追踪随访情况,对病毒载量检测在鉴别HIV-1抗体不确定病例的效果进行分析评价。方法对随访到的61例HIV-1抗体不确定受检者的蛋白印迹试验(WB)的条带类型进行分析,并进行病毒载量检测。结果2017-2018年,HIV-1抗体不确定病例73例,随访61例。在不确定的带型中,env类的带型占比最高(47.5%,29/61),其中gp160带型出现14例,占比23.0%(14/61);gp160+gp120带型出现15例,占比24.6%(15/61)。病毒载量检测值低于检出限(20拷贝/mL)的占13.1%(8/61),全部转归阴性。病毒载量检测值高于检出限的病例占86.9%(53/61),全部转归阳性。结论病毒载量检测能够有效确定WB方法判断的不确定结果,是有效的鉴别HIV-1抗体不确定结果的实验方法,病毒载量检测能够作为HIV抗体检测补充实验的辅助手段,作为HIV-1抗体不确定病例的辅助诊断。
- 张荣秋张建梅李莉
- 关键词：蛋白印迹试验随访病毒载量
- 不同治疗时间HIV/AIDS患者病毒载量和外周血淋巴细胞特征分析被引量：3
- 2023年
- 目的分析不同抗逆转率病毒治疗(ART)时间HIV/AIDS患者外周血淋巴细胞计数结果及病毒载量水平差异,揭示本市患者治疗后的免疫状态、治疗效果和病毒在血清中的抑制情况。方法将纳入的1627例患者治疗时间以年为单位分为6个组,使用流式细胞仪和病毒载量仪对患者外周血和血浆分别进行T淋巴细胞亚群计数和病毒载量检测,通过SPSS 25.0软件进行数据分析。结果病毒载量结果<20拷贝/ml的人数在不同治疗年份中均最高,治疗满1年和其余年份载量差异显著。外周血CD4^(+)T细胞中位数最低为治疗满1年组(431个/μl),CD8^(+)T细胞治疗5年以上组最低(737个/μl),治疗满3年人群中CD4^(+)T细胞>500个/μl的人数均超过一半。CD4^(+)T/CD8^(+)T比值>1.0的人数在治疗满1年组占比最低。治疗满1年、2年组CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞、CD4^(+)T/CD8^(+)T比值与其余组间差异有统计学意义(P<0.05)。载量与CD4^(+)T细胞及CD4^(+)T/CD8^(+)T比值成负相关关系(P<0.05),与CD8^(+)T成正相关关系(P<0.05)。结论ART时间满1年以上,人群中病毒载量水平差异较小;治疗2年以上,CD4^(+)T细胞、CD8^(+)T细胞数量及其比值接近。
- 张建梅张荣秋温娟李莉
- 关键词：艾滋病病毒病毒载量T淋巴细胞
- 一种用于固定接种感染性体液培养瓶的装置
- 本申请涉及一种用于固定接种感染性体液培养瓶的装置，包括底座、支撑杆、固定台及至少一个固定装置；所固定台以所述支撑杆支撑固定在所述底座上；所述固定装置可拆卸固定在所述固定台上，所述固定装置用于固定培养瓶；所述支撑杆设置为可...
- 温娟张建梅张荣秋赵靖悦洪超
- 厦门市2018—2022年诺如病毒分子分型研究
- 2023年
- 目的研究厦门市诺如病毒基因型分布,发现暴发疫情的优势型别。方法收集厦门市2018—2022年56起暴发事件样本,以实时荧光PCR法进行诺如病毒定性检测,阳性样本再用一步法RT-PCR对聚合酶和衣壳区序列进行特异扩增,目标片段进行序列测定和系统进化树分析。结果厦门市2018—2022年诺如病毒检出率47.3%(233/493),阳性样本GII组占89.3%(208/233)、GI组占10.7%(25/233),共有3起事件为混合感染;共97份样本成功获得基因序列,所有序列分8个亚型;暴发事件数中占比前2位为GII.2[P16](44.6%,25/56)和GII.4_Sydney2012[P31](12.5%,7/56);2019年诺如病毒的型别较为多(7个),其他年份型别仅1~3个;GII.2[P16]毒株序列间相似度92.9%~99.8%,分别与2018年广东省MK614136、2019年上海市MT158852和日本OR018215等序列相似度较高;GII.4_Sydney2012[P31]序列间相似度93.1%~99.2%,大部分该型毒株与2019年北京市MW205646序列相似度高(96.9%~99.6%)。结论厦门市诺如病毒暴发疫情基因型呈多样性,GII.2[P16]为2018—2022年流行的优势型别。
- 张建梅徐雪荣陈泽辉叶规格张荣秋
- 关键词：诺如病毒基因分析疫情暴发
- 厦门地区17株B型流感病毒的基因组测序分析被引量：1
- 2016年
- 目的了解2015年厦门地区17株B型流感病毒的基因组序列特征。方法利用高通量测序对17株B型流感病毒进行全基因组序列测定,并分析基因进化特性。结果成功获得17株B型流感病毒的全基因组序列,其中Yamagata系病毒16株,Victoria系病毒1株。与WHO推荐的疫苗株B/Massachusetts/2/2012比较,Yamagata系病毒的HA和NA氨基酸序列均发生了变异。结论厦门地区人群中流行的乙型流感病毒的抗原性和基因特性在逐渐发生变异,HA和NA基因序列部分位点与疫苗株存在差异,可能导致其抗原性发生改变。
- 张荣秋蒋丽娜沈惠燕李莉黄建炜
- 关键词：B型流感病毒基因组测序进化树
- 厦门市新发现HIV-1感染者分子流行病学及原发性耐药分析
- 2022年
- 目的了解厦门市新发现HIV-1感染者的HIV-1亚型的型别,进而了解亚型变化以及传播途径,分析其原发性耐药情况。方法收集新发现HIV-1感染者的血浆样品,用罗氏公司的Tanman48进行实时荧光定量PCR测定HIV病毒载量,提取HIV病毒RNA,采用巢式PCR方法扩增gag-pol和env区基因片段、测序,进行分子流行病学分析和耐药基因型分析。结果85例Gag-pol与各亚型标准序列构建的系统进化树显示,CRF01_AE重组型为76例(89.41%),CRF07_BC重组型为5例(5.88%),CRF08_BC重组型为2例(2.35%),B’亚型为2例(2.35%)。共有4例耐药位点突变,原发性耐药率为4.68%。在4例原发性耐药标本中,PIs相关突变株1株,主要突变位点为M46I/L,表现为对NFV中度耐药和对LPV/r、FPV/r、ATV/r潜在耐药;NRTIs相关突变株1例,主要突变位点为D67N和L74V,表现为对ABC中度耐药和对AZT低度或者潜在耐药;NNRTIs相关突变株2例,主要突变位点为V179E和E138A,表现为对EFV、NVP、ETR潜在耐药和对RPV低度或者潜在耐药。结论厦门市新发现HIV感染者以CRF07_BC流行重组型为主,该人群中原发性耐药属于低流行区,但是原发性耐药已经开始传播,应参照原发性耐药检测为新发现HIV-1感染者制定首选治疗方案。
- 张荣秋温娟邱艺燕张建梅
- 关键词：原发性耐药基因突变
- 一株O139群霍乱弧菌产毒株全基因组测序及序列分析
- 2022年
- 目的了解霍乱弧菌(Vibrio cholerae)O139群产毒株的基因序列,为霍乱基因组学研究提供资料,对可能发生的公共卫生突发事件提供依据和支撑。方法利用Illumina Hiseq测序平台对1株O139群霍乱弧菌O139进行了全基因组测序,利用短序列组装软件SOAPdenovo2对基因组进行组装,利用Glimmer,GeneMarkS,Prodigal软件对基因组中的编码序列(CDS)进行预测基因和功能注释。结果O139基因组大小为4.28 Mb,GC含量为47.6%,预测编码基因3870个。在O139基因组中注释到3422个基因具有直系同源蛋白簇分类,共查到88个tRNA和6个rRNA基因。与代谢通路相关基因2775个,与生物被膜有关基因88个。与毒力相关基因441个。通过KEGG定位到RTX和CTX毒力相关基因簇。结论霍乱弧菌O139携带多种毒力相关基因,对该菌致病性及环境适应性起到关键作用。
- 张荣秋温娟张建梅
- 关键词：霍乱弧菌生物被膜毒力因子
