田菲
- 作品数:18 被引量:30H指数:3
- 供职机构:中国科学院西北高原生物研究所更多>>
- 发文基金:国家自然科学基金青海省自然科学基金国家重点实验室开放基金更多>>
- 相关领域:生物学农业科学文化科学经济管理更多>>
- 几何形态测量法结合Micro CT扫描对两水系花斑裸鲤的形态分析被引量:4
- 2020年
- 研究采用现代几何形态测量法并结合Micro CT扫描技术对两水系(黄河上游与柴达木水系格尔木河)花斑裸鲤(Gymnocypris eckloni Herzenstein)的形态进行定量分析,讨论两水系花斑裸鲤是否存在先前研究未能发现的形态差异。结果显示:花斑裸鲤的两个地理种群在基于其头部形态轮廓二维坐标的主成分分析和判别分析的结果均聚在一起,这与之前文献记载的两水系花斑裸鲤的形态学特征相一致,并且对两水系花斑裸鲤进行的典型变量分析也同样支持这一结果;对花斑裸鲤两个地理种群背鳍支鳍骨插入椎骨间的相对位置这一形态特征进行卡方检验,结果表明在骨骼这一更具分类学意义的形态特征上表现出显著性差异。通过对花斑裸鲤两个地理种群的几何形态与Micro CT扫描,准确定量地分析了两水系花斑裸鲤形态上的异同,为正确评价两水系花斑裸鲤真实的演化关系奠定了形态学基础。
- 李晓慧汤永涛田菲赵凯
- 一种检测斑马鱼Acsl1a基因突变的方法
- 本发明提供了一种检测斑马鱼ACSL1a基因突变的方法,包括提取斑马鱼基因组DNA,引物扩增、Hpy188I内切酶、琼脂糖凝胶电泳分析步骤。本发明方法可以高效鉴别斑马鱼Acsl1a第7外显子TCTGA基因序列是否缺失,通过...
- 刘思嘉牛依萌田菲田得红王贺崐元赵凯
- 文献传递
- 一种青海湖裸鲤胚胎培养液及其制备方法
- 本发明公开了一种青海湖裸鲤胚胎培养液及其制备方法,属于渔业养殖技术领域。所述培养液包含以下组分:NaCl、KCl、CaCl2、MgSO4、Na2HPO4、KH2PO4、NaHCO3、亚甲基蓝、庆大霉素。本发明的培养液模拟...
- 刘思嘉田菲田得红王贺崐元李晓环赵凯
- 文献传递
- 一种青海湖裸鲤胚胎培养液及其制备方法
- 本发明公开了一种青海湖裸鲤胚胎培养液及其制备方法,属于渔业养殖技术领域。所述培养液包含以下组分:NaCl、KCl、CaCl2、MgSO4、Na2HPO4、KH2PO4、NaHCO3、亚甲基蓝、庆大霉素。本发明的培养液模拟...
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- 一种RGMB基因突变及其在产羔数高的绵羊的筛选上的应用
- 本发明提供了一种RGMB基因突变及其在产羔数高的绵羊筛选上的应用,属于SNP检测领域。本发明提供了产羔数高的绵羊筛选试剂盒,它包括检测绵羊参考基因组第5号染色体的第95132658位点的试剂。本发明还提供了产羔数高的绵羊...
- 韩步鹰田得红赵凯李雪王雷裴全帮仁欠本刘德会王松刘思嘉田菲
- 本土绵羊品种GH与IGF-1基因多态性分析
- 2021年
- 生长性状是绵羊育种中关注的重要性状。GH和IGF-1基因已被证明是影响动物生长发育的重要候选基因。因此,了解中国本土绵羊GH和IGF-1基因的遗传多样性,将为提高本土绵羊的生产效率、制定遗传育种和品种改良措施奠定基础。本研究以本土绵羊品种呼伦贝尔羊、藏羊、湖羊、阿勒泰羊、小尾寒羊和滩羊为主要研究对象,以澳白羊为参考,通过Sanger测序检测了340只绵羊GH和IGF-1外显子单核苷酸多态性。研究发现,GH和IGF-1基因外显子区分别检测到11个和3个SNPs,呈品种特异性分布,在群体中处于低度至中度多态。连锁不平衡分析发现,GH基因的SNP1、SNP3、SNP6、SNP7和SNP8呈强连锁不平衡,构建的7种单倍型中,CGACAG是优势单倍型(52.6%),而IGF-1基因的3个SNPs之间连锁关系很弱。生物信息学分析发现,检测到的14个SNPs中GH的SNP2、SNP4、SNP8和IGF-1的SNP1、SNP3为新发现的多态位点,其中SNP4和SNP9为错义突变,可能会导致编码蛋白质二级结构与三级结构发生改变。研究结果表明,与其他本土品种和澳白羊相比,湖羊的GH和IGF-1基因具有较为丰富的遗传变异。已有研究证实GH的SNP6和SNP9以及IGF-1的SNP2不同基因型与绵羊的生长和胴体性状相关联,且在本土品种中均有多态,推测GH基因的SNP6、SNP9和IGF-1基因的SNP2可作为本土绵羊生长性状分子标记辅助选择的候选SNPs。
- 丁宁刘思嘉田菲田得红李雪赵凯
- 关键词:生长激素胰岛素样生长因子基因多态性绵羊
- 一种呼伦贝尔羊SNP数据库的构建方法
- 本发明属于基因技术领域,具体涉及一种呼伦贝尔羊SNP数据库的构建方法。本发明的构建方法包括以下步骤:步骤1,获取呼伦贝尔羊测序数据;步骤2,对测序数据进行质量控制,得到质控后数据;步骤3,将质控后数据中的reads分别映...
- 李雪刘思嘉田得红韩步鹰刘德会丁宁付德军宋晓亮田菲赵凯
- 文献传递
- 一种用于实验室养鱼的鱼缸
- 本实用新型公开了一种用于实验室养鱼的鱼缸,包括鱼缸本体,所述鱼缸本体的内部设置有日光灯与监测机构,所述日光灯位于监测机构的一侧,所述鱼缸本体的上端外表面设置有固定挡板,所述固定挡板的上端外表面设置有氧气置换装置与开口槽,...
- 刘思嘉田菲田得红赵凯
- 文献传递
- 鲤在低温胁迫下肝胰腺转录组测序分析被引量:6
- 2018年
- 检测低温耐受与低温敏感鲤品种低温胁迫下的差异表达基因,探究鲤低温适应的分子应答过程。低温胁迫后对松浦镜鲤及荷包红鲤肝胰腺进行转录组测序,并对表达差异基因进行功能、通路富集分析。通过差异表达分析,共获得10 521个差异表达基因,其中5 246个基因仅在低温耐受品种发生表达变化。功能、通路富集分析将差异基因显著富集在包括糖酵解/糖质新生代谢途径在内的144个代谢途径。选取5个基因进行qRT-PCR验证,定量结果与RNA-seq结果相关性达0.89。研究结果表明低温胁迫会显著改变鲤肝胰腺的转录活动,编码糖酵解/糖质新生途径的多个关键酶基因在低温耐受品种的表达量显著高于低温敏感品种,推测这些基因功能有助于其长期低温适应。
- 刘思嘉田菲田菲张存芳赵凯
- 关键词:肝胰腺转录组测序
- 青海湖裸鲤高原极端环境适应的基因组基础
- 裂腹鱼亚科隶属鲤形目中的鲤科,是鲤科鱼类中唯一一种适应青藏高原极端环境的自然群体。青海湖裸鲤(Gymnocypris przewalskii przewalskii)主要栖息于典型高原咸水湖泊——青海湖中,是裂腹鱼类中研...
- 田菲赵凯
- 关键词:青海湖裸鲤基因组适应性进化
- 文献传递