周雅莉
- 作品数：15 被引量：29H指数：4
- 供职机构：山西农业大学农学院更多>>
- 发文基金：国家杰出青年科学基金国家自然科学基金山西省自然科学基金更多>>
- 相关领域：农业科学生物学更多>>
- 紫苏脂肪酸硫酯酶基因PfFatA生物信息学及其表达特性分析被引量：3
- 2017年
- 为研究脂肪酸硫酯酶A(FatA)在紫苏脂肪酸合成机制中发挥的作用,对紫苏FatA基因及其编码的蛋白质进行生物信息学分析。结果表明,PfFatA基因cDNA全长1 652 bp,开放阅读框1 119 bp,编码372个氨基酸;紫苏FatA基因编码的蛋白质为亲水性不稳定蛋白,无跨膜区域;含Acyl-ACP_TE保守结构域,属于Hotdog fold超蛋白家族;多序列比对结果发现,序列C端含有保守的三联肽AKL和SKV结构;系统进化树分析表明,紫苏与丹参亲缘关系较近。通过Real-time PCR分析得知,PfFatA在紫苏根、茎、叶、花和种子不同发育时期均有表达,其中,在种子发育初期表达量最高。该研究结果可为进一步阐明PfFatA基因的功能及作用机制奠定基础。
- 李璐梁倩安茜周雅莉王计平
- 关键词：紫苏生物信息学
- 紫苏caleosin 基因克隆及表达分析
- 2022年
- 油体钙蛋白(caleosin)是参与油体合成的一类蛋白质。本研究从紫苏转录组数据库中筛选获得caleosin的PfClo1和PfClo2两个基因片段,通过表达特性分析发现,PfClo2基因在紫苏不同组织中几乎不表达,故选定PfClo1基因进行克隆及实时荧光定量聚合酶链式反应(qRT-PCR)分析,探究基因PfClo1在紫苏不同品种中的表达特性及对干旱胁迫的响应。紫苏caleosin的PfClo1基因序列分析结果表明,PfClo1基因的开放阅读框(ORF)序列为609 bp,共编码202个氨基酸,理论等电点为5.19,亲水性系数为0.678,PSORT软件预测PfClo1蛋白定位于细胞质;BLAST同源序列比对表明,PfClo1与丹参和芝麻的caleosin序列相似性较高,属于典型的caleosin家族成员;qRT-PCR分析结果表明,PfClo1基因在‘晋紫苏1号’的花和种子中均有表达,且在开花后30 d的种子中表达量最高;通过分析不同紫苏品种的差异表达发现,PfClo1基因的表达与紫苏油脂合成存在一定的正相关关系;用20%聚乙二醇(PEG)对‘晋紫苏1号’幼苗进行干旱胁迫处理后发现,PfClo1基因在胁迫处理12 h时表达量达到最高,为对照的6.78倍,推测该基因可能在紫苏干旱胁迫诱导中发挥调控作用。该研究结果为深入探究PfClo1基因在紫苏种子发育及干旱胁迫应答中的功能提供了理论依据。
- 王超史华平董书言邢志周雅莉王计平李润植
- 关键词：紫苏基因克隆干旱胁迫
- 紫苏Pfgpat9基因的鉴定与功能分析被引量：1
- 2020年
- 甘油三磷酸酰基转移酶(GPAT)是三酰甘油(TAG)合成过程中的关键酶。本研究从油料作物紫苏中筛选鉴定得到甘油三磷酸酰基转移酶基因Pfgpat9,并揭示其编码蛋白特征及基因功能。从紫苏转录组数据库中筛选获得gpat9基因片段,以优选品种‘晋紫苏1号’为材料,通过RT-PCR技术克隆获得该基因的开放阅读框(ORF)全长序列,命名为Pfgpat9;利用实时荧光定量PCR方法分析Pfgpat9基因在紫苏根、茎、叶、花及不同发育时期种子(开花后10、20、30、40 d)中的组织表达特性;通过双酶切将紫苏Pfgpat9基因完整的ORF序列连接到酵母表达载体pYES2.0上,将重组质粒转化至野生型酵母菌株INVSc1和缺陷型酵母gat1,并验证该基因的功能。结果显示:紫苏Pfgpat9基因ORF为1116 bp,共编码371个氨基酸,理论等电点pI为8.96,不稳定系数为46.67,亲水性系数为-0.108,是一种亲水性不稳定蛋白。紫苏Pfgpat9基因具有典型的GPAT9功能结构域,包含3个典型的跨膜螺旋区;多序列比对分析表明,紫苏Pf GPAT9蛋白与油橄榄、茶树和向日葵GPAT9蛋白的亲缘关系较近;qRT-PCR分析显示,Pfgpat9基因在紫苏不同组织中均表达,在种子发育不同时期表达量呈先升高后降低趋势,在开花后20 d表达量达到最高;酵母转化结果表明,转Pfgpat9基因野生型酵母和转Pfgpat9基因缺陷型酵母总脂含量均提高,且C16∶0、C16∶1含量均有所提高。研究表明,Pfgpat9基因在紫苏种子油脂合成积累过程中发挥重要作用,这为进一步通过基因工程及转基因技术改良紫苏品质提供了新的方向。
- 任文燕郝月茹李润植周雅莉杨宏斌王计平
- 关键词：紫苏
- 紫苏bZIP转录因子全基因组鉴定及对非生物胁迫的响应分析
- 2023年
- 碱性亮氨酸拉链(bZIP)是一类普遍存在于真核生物的转录因子,广泛参与植物生长发育与逆境胁迫响应等生命过程。为解析紫苏(Perilla frutescens)bZIP(PfbZIP)蛋白的生物学功能,本研究应用组学工具全基因组鉴定PfbZIP家族成员及其理化特征,定量PCR检测PfbZIP基因响应非生物胁迫的表达谱,克隆PfbZIP90编码序列,并进行烟草(Nicotiana tabacum)遗传转化。结果表明,紫苏基因组共鉴定到101个PfbZIP家族成员,不均匀分布于18条染色体。PfbZIP蛋白序列长度在112~1269 aa之间,等电点(pI)为4.84~10.88。主要由二级结构单元α-螺旋和无规则卷曲维持PfbZIP蛋白自身结构。亚细胞定位预测PfbZIP定位于细胞核。片段重复是PfbZIP基因家族进化和扩增的主要驱动力。不同PfbZIP成员之间外显子和内含子数目及分布差异较大。PfbZIP蛋白具有高度保守的碱性区域和亮氨酸拉链结构区域。系统进化分析将PfbZIP家族成员划分为10个亚群。PfbZIP基因启动子区包含大量非生物胁迫响应的顺式元件。表达谱分析显示部分PfbZIP基因表达水平在低温和干旱胁迫的紫苏幼苗以及对照植株中差异显著,其中PfbZIP90在低温和干旱胁迫下均显著上调。与非转基因对照相比,异源超表达PfbZIP90的转基因烟草株系可溶性糖含量升高,电导率和丙二醛含量则显著降低,Nt FAD3基因表达和α-亚麻酸(ALA)含量亦显著增加。这表明PfbZIP90能有效介导紫苏和烟草低温和干旱胁迫应答以及脂肪酸合成调控。这些发现为全面探究PfbZIP家族成员的生物学功能,特别是介导非生物胁迫响应的分子调控机制和油脂品质改良提供了新的科学基础。
- 黄旭升周雅莉史先飞高宇董书言蔡桂萍李润植王计平
- 关键词：紫苏非生物胁迫Α-亚麻酸
- 紫苏二酰甘油酰基转移酶基因(PfDGAT1)鉴定及表达分析被引量：3
- 2019年
- 二酰甘油酰基转移酶(DGAT)是TAG合成过程中的限速酶。以晋紫苏1号为材料,采用电子克隆技术获得DGAT1基因(PfDGAT1,AF298815.1),并对PfDGAT1基因序列进行生物信息学及表达特性分析。结果表明,PfDGAT1基因序列全长为1 964 bp,开放阅读框长度为1 605 bp,共编码534个氨基酸残基;多序列比对和系统进化树分析表明,紫苏Pf DGAT1蛋白与芝麻、油橄榄的DGAT1蛋白的亲缘关系较近,序列同源性分别为89%和83%;利用实时荧光定量PCR技术分析PfDGAT1基因在紫苏不同组织中的表达特性,结果显示,PfDGAT1基因在紫苏不同组织中均有表达,但在种子中表达量最高,且随种子发育表达量呈先升高后降低的变化趋势,在开花后20 d表达量达到最高。
- 周雅莉任文燕郝月茹安茜段露露李润植王计平
- 关键词：紫苏基因克隆
- 紫苏PfPDCT基因序列特征及表达分析
- 2019年
- 采用生物信息学技术和在线分析软件对紫苏PfPDCT基因序列及所编码的蛋白质进行分析,并且利用实时荧光定量PCR技术研究该基因在晋紫苏1号种子发育不同时期的表达特性,旨在探究磷脂酰胆碱甘油二脂转磷酸胆碱酶(PDCT)在植物脂肪酸代谢过程的作用。结果表明,紫苏PfPDCT基因c DNA全长序列为2 098 bp,开放阅读框为1 683 bp,编码560个氨基酸残基。生物信息学分析结果表明,PfPDCT蛋白分子量约为59.315 ku,等电点为9.48,不稳定系数为35.00,推测其为稳定蛋白,与已知赤藓PDCT蛋白高度同源。通过荧光定量PCR分析可知,紫苏PfPDCT基因在不同发育时期的种子中均有表达,其中,在开花后20 d表达量最高,为开花后10 d的1.92倍。研究结果可为进一步阐明紫苏PfPDCT基因的功能及作用机制奠定基础。
- 任文燕周雅莉杨慧娟郝月茹杨宏斌李润植王计平
- 关键词：紫苏脂肪酸代谢生物信息学分析
- 紫苏PfDGAT1酵母功能互补分析被引量：3
- 2019年
- [目的]本试验将已克隆的紫苏种子中高表达二酰甘油酰基转移酶(DGAT)基因 PfDGAT 1 转化至酿酒酵母突变型菌株H1246进行酵母互补功能验证,研究二酰甘油酰基转移酶是否具有催化油脂合成的作用。[方法]通过构建紫苏 DGAT 基因的酵母表达载体pYES2.0- PfDGAT 1 并转化至酿酒酵母突变型菌株H1246,用尼罗红对转基因酵母细胞染色,检测转基因酵母中是否能合成油体;利用薄层层析(TLC)试验检测转基因酵母中是否存在三酰甘油(TAG)。[结果]转pYES2.0- PfDGAT 1 载体的突变型酵母菌株H1246能够检测到有油体存在,而转pYES2.0空载体的突变型酵母菌株H1246中没有检测到油体,说明紫苏 PfDGAT 1 基因的表达恢复了酿酒酵母突变型菌株H1246油体缺陷的表型,可以催化TAG合成。[结论] PfDGAT 1 基因在紫苏种子油脂合成积累过程中发挥重要作用,该研究结果为深入解析 PfDGAT 1 基因在紫苏油脂合成途径中的功能奠定了基础。
- 王计平周雅莉任文燕安茜段露露郝月茹李润植
- 关键词：紫苏
- 食药同源作物紫苏α-亚麻酸生物合成及调控机制的研究
- 【研究背景】紫苏(Perilla frutescens (L.) Britt.)是一种重要的食药同源油料作物,其种子含油量高达46%～58%,且主要为人体必需脂肪酸即α-亚麻酸(18:3Δ9,12,15,ALA,含量>6...
- 周雅莉黄旭升李润植王计平
- 关键词：Α-亚麻酸转录因子
- 紫苏PfDGAT2基因生物信息学及表达特性分析被引量：5
- 2017年
- 为研究二酯酰甘油酰基转移酶2(PfDGAT2)在紫苏种子油脂合成过程中的调控作用,对紫苏DGAT2基因及其编码的蛋白质进行了详细的生物信息学分析,并研究了该基因在不同紫苏品种中的表达特性。结果表明,PfDGAT2基因c DNA全长1 249 bp,共编码329个氨基酸;DGAT2蛋白的等电点为9.46,属于碱性蛋白质;二级结构预测表明,紫苏DGAT2蛋白的主要结构元件是无规则卷曲(34.65%)和α-螺旋(30.09%);系统进化树分析表明,紫苏与芝麻和烟草的亲缘关系较近,与油橄榄的亲缘关系较远。通过研究PfDGAT2基因在含油量不同的2个紫苏品种种子发育的不同时期表达特性,结果表明,该基因在开花后30 d形成的种子中表达量最高,但是二者又具有一定差异,晋紫苏1号(含油量46.88%)表达量为开花后10 d的1.63倍,并紫苏1号(含油量35.60%)为0.75倍,因此,推测DGAT2在紫苏TAG生物合成中起重要调控作用。
- 梁倩李璐周雅莉安茜王计平
- 关键词：紫苏生物信息学
- 大豆GmWIN1-6 转录因子的鉴定、表达分析及盐胁迫响应
- 2021年
- 为鉴定可用于大豆(Glycine max)遗传改良的优异基因源,从大豆基因组中鉴定获得一个大豆GmWIN1-6转录因子,应用生物信息学工具和实时荧光定量反转录PCR(qRT-PCR)技术系统分析GmWIN1-6转录因子的理化性质、蛋白结构、时空表达谱及盐胁迫响应。结果表明:从大豆花组织中克隆到GmWIN1-6基因的开放阅读框(ORF),其编码蛋白由176个氨基酸组成,在N端具有一个保守的AP2结构域,属于亲水性蛋白;GmWIN1-6蛋白的二级结构中,无规则卷曲占比例最大;三级结构与拟南芥(Arabidopsis thaniana)AtWIN1相似;系统进化分析显示GmWIN1-6与AtWIN1亲缘关系最近;GmWIN1-6转录因子在大豆各组织中的表达差异明显,其中在花组织中表达量最高,其次为种子发育中后期,且与种子油脂积累时期基本吻合;在大豆幼苗盐胁迫条件下,GmWIN1-6基因上调表达。这些试验发现预示着GmWIN1-6转录因子可能参与大豆种子发育和油脂富集以及幼苗胁迫响应的调控,为大豆遗传改良和分子育种提供理论依据。
- 蔡桂萍刘宝玲周雅莉邓咪咪高慧玲李腾张莉李润植
- 关键词：大豆盐胁迫
