徐倩
- 作品数：11 被引量：3H指数：1
- 供职机构：贵州大学更多>>
- 发文基金：贵州省农业攻关项目国家自然科学基金国家高技术研究发展计划更多>>
- 相关领域：农业科学医药卫生更多>>
- 一种区分中国地方猪种和大白猪的分子标记SV193及其应用技术
- 本发明公开了一种区分中国地方猪种和大白猪的分子标记SV193及其应用技术，其特征在于：SV193位于猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr8:142093174‑142093446，SV193缺失基因定为D，正常不...
- 冉雪琴王嘉福徐倩牛熙
- 文献传递
- 香猪睾丸miR-449b和miR-222分子的发育性变化被引量：1
- 2017年
- 为了阐明miR-449b和miR-222对贵州从江香猪睾丸发育的调节作用。运用qPCR方法检测香猪睾丸组织中miR-449b和miR-222表达量的发育性变化,通过miRSystem数据库、Kobas数据库对预测的靶基因进行信号转导通路富集分析。经克隆测序,得到香猪miR-222序列,与猪的相似性为100%,而且物种之间miR-449b和miR-222两个分子的保守性都很高。香猪睾丸中miR-449b于1~4月龄期间的表达量逐渐上升,4月龄时表达量达到峰值,之后下降;miR-222的表达量呈现相反的变化趋势,于1~4月龄期间表达量逐渐下降,1月龄时最高,4月龄时最低,之后的表达量有所回升;已知物种的miR-449b和miR-222序列高度保守;经预测miR-449b靶基因有420个,富集于卵母细胞减数分裂、Notch信号通路、Ras信号通路等100个途径(P<0.05),miR-222的靶基因有429个,富集于细胞周期、Fox O信号通路、TGF-β信号通路等69个通路(P<0.05);miR-449b和miR-222的靶基因共享的通路为Wnt信号通路、MAPK信号通路、雌激素信号通路等42个(P<0.05)。
- 岑永秀徐倩黄世会冉雪琴王嘉福
- 关键词：香猪睾丸MIR-222
- 6个猪品种CD53基因中结构变异SV184分布频率的研究
- 2017年
- 基于香猪全基因组重测序数据,在白细胞表面抗原CD53基因中筛选到一个结构变异(structure variant,SV)184,为了探索不同猪品种间此结构变异是否存在多态性变化,本试验选择香猪、大白猪、糯谷猪、柯乐猪、江口萝卜猪和荣昌猪作为试验动物,采用PCR方法对猪群中SV184的分布频率进行比较研究,应用RT-PCR技术,分析CD53基因的原初转录本序列结构,研究SV184对CD53基因的转录是否有直接影响。结果显示,6个猪品种中SV184的分布频率存在明显差异,香猪以VN基因型为主,其他5个猪品种是NN基因型占优势;计算两种等位基因的频率,香猪以缺失的V等位基因为主,其他5个猪品种以正常的N等位基因为主。选择3种基因型个体的血液样本,逆转录后分析CD53基因的原初转录本的序列,从中检测到缺失型和不缺失的两种转录本形式,提示SV184对CD53基因的转录无直接影响。SV184可作为分子标记用于区分香猪和其他猪品种。
- 徐倩岑永秀喻昌燕刘畅冉雪琴王嘉福
- 关键词：多态性
- 一种利用SMAD5基因中SV314分子标记区分中国地方猪品种与大白猪的检测技术
- 本发明公开了一种利用SMAD5基因中SV314分子标记区分中国地方猪品种与大白猪的检测技术，其特征在于：SV314位于猪参考基因组Sscrofa 11.1的chr2:138335008‑138335321(SMAD5基因...
- 冉雪琴黄世会徐倩牛熙王嘉福
- 文献传递
- 一种区分大白猪和中国地方猪品种的结构变异SV177及其检测技术
- 本发明公开了一种区分大白猪和中国地方猪品种的结构变异SV177，其特征在于：SV177位于猪参考基因组Sscrofa 10.2的chrX:100561156‑100562159，SV177缺失基因定为D，正常不缺失的基因...
- 冉雪琴王嘉福徐倩牛熙
- 文献传递
- 一种区分中国地方猪种和大白猪的分子标记SV193及其应用技术
- 本发明公开了一种区分中国地方猪种和大白猪的分子标记SV193及其应用技术，其特征在于：SV193位于猪参考基因组Sscrofa 10.2的chr8:142093174‑142093446，SV193缺失基因定为D，正常不...
- 冉雪琴王嘉福徐倩牛熙
- 文献传递
- 贵州矮马SHOX基因的鉴定及其多态性研究
- 2015年
- 矮小同源盒基因(SHOX)突变是儿童身材矮小的重要原因。贵州矮马的体高和前膊长较小,但不清楚马基因组中是否有SHOX基因。本研究采用PCR和RT-PCR方法 ,从贵州矮马血液和心脏中克隆SHOX基因F1和F2片段;经测序研究贵州矮马SHOX基因的多态性。结果表明:从贵州矮马基因组中克隆到F1片段279 bp,从心脏总RNA逆转录得到F2片段216 bp,分别对应于人SHOX基因外显子2和外显子3区域;片段F2编码72个氨基酸,其中Ser16为磷酸化位点,且含有DNA结合结构域N端的45个氨基酸;片段F1对应于马参考基因组未定位的Scaffold 118中,推测马SHOX基因可能位于X染色体的短臂末端;从SHOX基因2个片段的序列中找到6个变异位点,但贵州矮马群体中各SNP位点的分布频率与伊犁马之间没有明显差异;矮马个体中存在SHOX基因的单核苷酸变异,可能参与骨的发育调节。本研究结果表明,马基因组中存在SHOX基因,且有转录活性,SHOX基因外显子2和3的序列保守,基因的变异可能参与个体的骨发育调节。
- 冉雪琴赵星艳岑永秀徐倩王嘉福李升阮涌
- 关键词：多态性体高伊犁马
- 6个猪品种7个结构变异的多态性及其功能研究
- 本文从六头香猪的全基因组重测序数据中，选择香猪特有的免疫、繁殖和生长等性状相关的结构变异，以香猪、柯乐猪、糯谷猪、江口萝卜猪、荣昌猪和大白猪为研究对象，进行群体研究，探索基因组中结构变异的多态性分布及其对基因表达的作用。...
- 徐倩
- 关键词：香猪基因组多态性分布基因转录
- 7个猪品种IBSP基因结构变异SV13的群体分析被引量：1
- 2017年
- 应用Hiseq 2000平台测定了香猪的全基因组序列,从中发现整合素结合涎蛋白(IBSP)基因内含子4中存在结构变异,命名为SV13,为了进一步探究SV13在猪群体中的分布,采用PCR技术检测了7个猪品种的SV13基因型。7个猪品种群体中均存在DD、DA和AA三种基因型,对纯合的DD和AA基因型测序,明确D等位基因缺失了227 bp。香猪、可乐猪和糯谷猪群体以DD为优势基因型,大白猪以AA基因型为主,6个地方猪品种群体中D的基因频率明显高于大白猪品种(P<0.01),香猪和大白猪群体基因型频率处于Hardy-Weinberg不平衡状态(P<0.05)。SV13可以作为辅助鉴别6个地方猪品种和大白猪的分子标记。
- 喻昌燕刘畅徐倩王嘉福冉雪琴
- 关键词：地方猪品种
- 一种区分大白猪和中国地方猪品种的结构变异SV177及其检测技术
- 本发明公开了一种区分大白猪和中国地方猪品种的结构变异SV177，其特征在于：SV177位于猪参考基因组Sscrofa 10.2的chrX:100561156‑100562159，SV177缺失基因定为D，正常不缺失的基因...
- 冉雪琴王嘉福徐倩牛熙
