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谢晓东

作品数:1 被引量:4H指数:1
供职机构:重庆大学生命科学学院更多>>
发文基金:中国烟草总公司科技项目更多>>
相关领域:农业科学更多>>

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇农业科学

主题

  • 1篇烟草
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇生物信息学分...
  • 1篇转录
  • 1篇转录因子
  • 1篇克隆
  • 1篇分子
  • 1篇分子克隆

机构

  • 1篇西南大学
  • 1篇重庆大学

作者

  • 1篇吴玉乾
  • 1篇王根洪
  • 1篇夏庆友
  • 1篇杨玲
  • 1篇谢晓东

传媒

  • 1篇烟草科技

年份

  • 1篇2014
1 条 记 录,以下是 1-1
排序方式:
烟草ABF转录因子基因的克隆与生物信息学分析被引量:4
2014年
为获得烟草AREB/ABF(ABA响应元件结合蛋白/ABRE结合因子)家族转录因子基因序列,进一步提高烟草的抗渗透胁迫能力,通过同源比对和RT-PCR技术,从烟草品种红花大金元中克隆到烟草AREB/ABF家族转录因子NtABF1(GenBank登录号为KF736849),NtABF2(GenBank登录号为KF736850)基因编码序列,并进一步利用生物信息学分析软件对这两个转录因子的蛋白理化性质、高级结构和生物学功能进行了预测。结果表明:NtABF1基因开放阅读框(Open Reading Frame,ORF)长999 bp,编码332个氨基酸,蛋白分子量36.45 kDa,等电点9.04;NtABF2基因ORF长1305 bp,编码433个氨基酸,蛋白分子量46.92kDa,等电点9.35。NtABF1和NtABF2均为含有BRLZ(Basic Region and Leucine Zipper)保守结构域的亲水蛋白,不含信号肽与跨膜结构。其高级结构均以α螺旋和无规则卷曲为主,β转角和延伸链含量较少。在亚细胞水平上,NtABF1和NtABF2均定位于细胞核。磷酸化位点分析表明,两蛋白均含有丝氨酸,苏氨酸和酪氨酸等激酶识别位点。进化分析和多序列比对结果表明,NtABF1与AtAREB3的进化关系最近,序列相似性达54.49%;NtABF2与SlAREB1,StABF1和StABF的亲缘关系较近,序列相似性分别为83.63%,83.52%和83%。功能预测结果显示,NtABF1和NtABF2均为转录调控因子。
杨玲吴玉乾谢晓东王根洪夏庆友
关键词:烟草分子克隆生物信息学
共1页<1>
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