李再磊
- 作品数：8 被引量：9H指数：2
- 供职机构：云南农业大学动物科学技术学院更多>>
- 发文基金：云南省科技厅科研基金更多>>
- 相关领域：农业科学更多>>
- 保山猪和杜洛克猪IGF-1基因的SNP筛选及生物信息学分析
- 2023年
- 试验旨在探究IGF-1基因单核苷酸突变位点对保山猪和杜洛克猪生长性能的影响。试验以保山猪和杜洛克猪为研究对象,采用直接测序法对IGF-1基因的多态性进行检测,利用生物信息学软件分析编码蛋白结构。结果显示:在保山猪IGF-1基因编码蛋白的外显子上共筛选出1个SNP位点(Exon4-G189A),该突变属于同义突变,引起密码子改变,但所编码的氨基酸未改变。生物信息学分析结果显示,保山猪IGF-1基因CDS区编码164个氨基酸,分子式为C782H1265N247O239S11,相对分子质量为18303.82,理论等电点为9.89,不稳定性指数为73.25,整体表现为亲水性,不具有跨膜结构,含有信号肽序列;蛋白质二级结构只含有无规则卷曲和α-螺旋,分别占60.37%、39.63%,三级结构预测模型与保山猪IGF-1基因的蛋白结构匹配度为-1.15,具有较好的一致性。研究表明,IGF-1基因在物种进化过程中高度保守,使其编码保山猪和杜洛克猪的氨基酸序列相同,蛋白质结构和功能差异很小或不存在差异,能否作为调控保山猪瘦肉少、脂肪多、生长慢的候选基因还需进行关联性的研究。
- 李文君富国文龚绍荣赵加鼎李再磊吴正明周戚斌赵桂英
- 关键词：保山猪杜洛克猪IGF-1SNP生物信息学
- FASN基因在保山猪3个组织中的表达量与背肌营养物质含量的关联分析
- 2022年
- 为了探索FASN基因在保山猪肝脏、背肌及背脂中的表达量与背肌营养物质含量的相关性,实验采用实时荧光定量PCR技术检测FASN基因在保山猪背肌、背脂、肝脏中的相对表达量,并与保山猪背肌营养物质含量进行关联分析。结果表明,FASN基因在保山猪3个组织中的表达趋势为:背脂>肝脏>背肌,各组织间的表达量均呈差异极显著;保山猪3个组织中FASN基因的表达量与背肌中氨基酸含量均呈不显著相关。保山猪在肝脏中FASN基因表达量与背肌中饱和脂肪酸含量呈极显著负相关,与不饱和脂肪酸含量呈极显著正相关,与棕榈酸呈显著负相关,与二十碳三烯酸、花生四烯酸和二十四烷酸均呈显著正相关。保山猪FASN基因的表达量对保山猪氨基酸含量的形成没有调控作用,对不饱和脂肪酸含量的形成具有调控作用,可作为影响保山猪不饱和脂肪酸含量的候选基因。
- 吴正明龚绍荣赵加鼎邱丙姗李再磊程娜李文君周戚斌赵桂英
- 关键词：保山猪营养物质含量
- 利用RNA-seq技术筛选火毛撒坝猪和杜洛克猪背最长肌差异基因被引量：2
- 2022年
- 本研究旨在利用RNA-seq技术研究中国地方猪种火毛撒坝猪优良性状的分子机制,发掘和鉴定地方猪种肉质性状和适应性的主效基因。屠宰火毛撒坝猪和杜洛克猪各4头,取背最长肌组织提取RNA,使用转录组测序筛选出差异表达的基因后进行GO和KEGG分析,研究了火毛撒坝猪和杜洛克猪2个猪种间3683个差异显著表达基因。结果表明,在富集的48条通路中,有6条信号通路与脂类代谢相关,其富集的过氧化物酶体增殖剂激活受体等差异表达基因与脂肪的代谢、沉积有关;初步筛选出6条与脂类代谢相关的通路和相关的基因。
- 李再磊窦必成赵玉香邱丙姗吴正明翁亚烦孙婷婷赵桂英
- 关键词：转录组测序杜洛克猪背最长肌
- 保山猪IGF2基因相对表达量与肉质性能的关联分析被引量：2
- 2021年
- 本研究旨在探究IGF2基因在保山猪3个组织中的相对表达量对其肉质性能的影响。利用荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测IGF2基因在保山猪背最长肌、背脂、肝脏3个不同组织中的相对表达量,并与保山猪肉质性状进行关联分析。结果表明:IGF2基因在3个组织中的表达量为肝脏>背脂>背最长肌;IGF2基因在保山猪背最长肌中的相对表达量与肌肉化学成分中的粗灰分呈显著负相关,与肌纤维密度呈显著正相关;在背部脂肪中的相对表达量与保山猪熟肉率成显著正相关,与肌肉pH1h和pH24h均呈显著负相关;在肝脏中的相对表达量与保山猪肌肉中的色差a(红度)呈显著负相关。研究表明IGF2基因相对表达量与保山猪肉质性状存在相关关系,但能否作为调控保山猪肉质性能的关键基因还需要进一步深入研究。
- 吴正明龚绍荣赵加鼎邱丙姗李再磊程娜李文君李云祥赵桂英
- 关键词：保山猪IGF2基因肉质性能
- 保山猪LPL基因表达量与生长及胴体性能的关联分析
- 2022年
- 为探究保山猪LPL基因相对表达量对生长性能、胴体性能的影响,本实验采用实时荧光定量PCR技术测定LPL基因在保山猪背最长肌、背脂和肝脏3个组织中的相对表达量,并分析LPL基因表达量与保山猪生长性能、胴体性能的关联性。结果显示,LPL基因在3个组织中的相对表达量从高到低依次为:背脂、背最长肌、肝脏;LPL基因在保山猪背最长肌中的相对表达量与皮比率呈极显著负相关;在背脂中的相对表达量与眼肌面积呈显著负相关,与脂比率呈显著正相关;在肝脏中的相对表达量与生长及胴体性能无显著相关性。研究说明LPL基因对保山猪的生长及胴体性能有一定影响,对保山猪的脂肪沉积有调控作用,可作为调控保山猪脂肪沉积的候选基因。
- 李文君程娜龚绍荣赵加鼎邱丙姗吴正明李再磊周戚斌赵桂英
- 关键词：保山猪LPL基因基因表达量胴体性能
- LPL基因表达量与高黎贡山猪脂肪酸含量的关联分析被引量：3
- 2021年
- 为了研究LPL基因表达量对高黎贡山猪肌肉脂肪酸含量的调控作用,本实验采用实时荧光定量PCR技术测定LPL基因在高黎贡山猪3个组织中的相对表达量,用气相色谱-质谱联用法对背最长肌脂肪酸含量进行测定,并将LPL基因相对表达量与肌肉脂肪酸含量进行关联分析。结果显示,LPL基因在高黎贡山猪3个组织中的相对表达趋势为:背脂>背最长肌>肝脏;LPL基因在肝脏组织中的相对表达量与肌内十六酸、亚油酸、二十二碳六烯酸、ω-3PUFA、ω-6PUFA含量呈显著负相关;在背最长肌组织中的相对表达量与ω-6/ω-3PUFA呈显著正相关;在背脂组织的相对表达量与肌肉脂肪酸含量无显著相关性。说明LPL基因对高黎贡山猪肌肉脂肪酸含量具有一定的调控作用,但能否作为影响高黎贡山猪脂肪酸沉积的主效基因还有待进一步验证。
- 邱丙姗吴正明李再磊李志勋陈哲赵桂英
- 关键词：LPL基因高黎贡山猪脂肪酸
- 云南省规模化养猪场疫病流行情况的问卷调查被引量：2
- 2014年
- 为了解云南省规模化养猪场疫病流行情况,分析疫病发生的特点和规律,本研究对云南省30家规模化养猪场2013年使用疫苗的种类、疫病流行情况、疫病严重程度、存在问题及需要的帮助、影响效益因素等方面进行了问卷调查。结果表明,按场群发病率,猪场最常见的疾病依次为腹泻、蓝耳病、猪瘟、圆环病毒、副猪嗜血杆菌、乙型脑炎和伪狂犬病。各场间疾病流行的种类、严重程度差异较大。在可能影响猪场效益的各因素中,依次为市场因素、疫病流行、饲养管理水平、饲料药品成本和国家政策。研究结果为猪场科学饲养、合理制定免疫预防计划提供依据,促进养猪业平稳、健康发展提供数据参考。
- 段新慧舒相华李再磊宋春莲杨贵树尹革芬李文贵
- 关键词：问卷调查规模化猪场疫病防控
- 基于RNA-Seq技术鉴定撒坝猪与杜洛克猪肝脏组织差异表达基因被引量：1
- 2021年
- 为了鉴定撒坝猪和杜洛克猪肝脏组织的转录组差异表达基因,揭示撒坝猪肉质性状和生长性状的相关遗传机理,实验以260日龄撒坝猪和杜洛克猪肥猪(各4头)为研究对象,用RNA-seq技术并结合现代高通量测序技术对撒坝猪和杜洛克猪的肝脏组织样品进行测序,鉴定并挑选撒坝猪和杜洛克猪肝脏组织中的差异表达基因,并对其进行GO功能和KEGG通路富集分析与可变剪接分析。从撒坝猪和杜洛克猪肝脏组织中共鉴定出差异表达基因2326个,其中上调表达基因1049个,下调表达基因1277个;在GO数据库中共检测到521个差异表达基因,在KEGG数据库中共检测到651个差异表达基因;经过对差异表达基因进行显著富集通路的分析挑选出可能与撒坝猪肉质和生长性状相关的通路20条;进一步与标准参考基因组对比分析共发掘出27499个差异可变剪接。说明PPAR信号通路等20条信号通路在撒坝猪的肉质形成和生长发育过程中起重要作用。本研究结果为猪种遗传改良提供了理论参考依据。
- 吴正明邱丙姗李志勋程娜翁亚烦李再磊赵桂英
- 关键词：肝脏转录组
