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张怡宇

作品数:4 被引量:18H指数:3
供职机构:广州医科大学更多>>
相关领域:医药卫生生物学更多>>

文献类型

  • 3篇期刊文章
  • 1篇学位论文

领域

  • 3篇医药卫生
  • 1篇生物学

主题

  • 3篇生物信息
  • 3篇生物信息学
  • 2篇生物信息学分...
  • 2篇基因
  • 2篇RNA
  • 1篇代谢
  • 1篇血小板
  • 1篇输血
  • 1篇输注
  • 1篇抢救
  • 1篇相容性
  • 1篇小分子
  • 1篇小分子RNA
  • 1篇紧急抢救
  • 1篇环状
  • 1篇基因测序
  • 1篇基因芯片
  • 1篇红细胞
  • 1篇非编码
  • 1篇分子

机构

  • 4篇广州医科大学
  • 1篇中国人民解放...
  • 1篇南方医科大学...

作者

  • 4篇张怡宇
  • 3篇魏亚明
  • 3篇黄建云
  • 2篇李楠
  • 2篇苑召虎
  • 2篇陈小洁
  • 1篇刘景汉
  • 1篇兰炯采
  • 1篇吴千羽
  • 1篇李楠

传媒

  • 3篇中国输血杂志

年份

  • 3篇2018
  • 1篇2016
4 条 记 录,以下是 1-4
排序方式:
储存红细胞ATP代谢circRNA筛选及功能预测被引量:3
2018年
目的筛选4℃储存前、后期红细胞差异表达的circRNA并初步预测其功能。方法采集健康无偿献血者5(人)份血样200 m L/份,制备成悬浮红细胞,滤除白细胞后(悬浮滤白红细胞)分为3组:4℃储存0、20及40 d组,对3组标本用第2代高通量测序技术检测,根据FDR〈0.05且|log2FC|〉1这2个条件,以火山图和表达模式聚类分析筛选出差异基因并用cytoscape作出mRNA—circRNA—miRNA网络图;通过KEGG和GO分析筛选出与ATP代谢相关的circRNA验证;最后通过生信软件预测hsacirc0007470—hsa-miR-155-5p—MRP4的分子结合具体区域及生物学功能。结果红细胞储存20 d较0 d时差异表达的circRNA有119个,40 d较20 d时差异表达的circRNA有110个,2个储存阶段都有差异表达的circRNA共有41个。KEGG和GO分析显示在差异表达的circRNA中hsacirc0007470的亲本基因MRP4富集于c AMP代谢通路。mireap、miranda、targetscan、circBase、miRBase、mirTar Base软件分析及序列比对显示hsacirc00007470可与hsa-miR-155-5p结合;hsa-miR-155-5p可与MRP4结合。经PCR验证,红细胞储存在0、20、40 d时,hsacirc00007470、MRP4、hsa-miR-155-5p的变化倍数分别为1.00±0.02、1.36±0.09、0.53±0.16,1.00±0.01、1.87±0.48、0.45±0.20,1.00±0.02、0.43±0.20、0.98±0.29。红细胞储存0、20、40 d时,总ATPase(U/gHb)分别是40.87±5.883、18.300±2.847、10.21±1.636;ATP(U/gHb)分别是8.708±1.25、3.082±0.166、2.462±0.252。结论储存红细胞中存在circRNA,且含量会随储存时间发生改变,储存20 d后红细胞的hsacirc00007470与ATPase及ATP表达呈同向相关性,hsacirc00007470或许能解除hsa-miR-155-5p对MRP4的抑制作用,通过ATP代谢途径改善红细胞变形能力。
张怡宇苑召虎黄慧瑛李秋娴李楠黄建云魏亚明
关键词:小分子RNACAMP生物信息学
储存去白红细胞内差异circRNA筛选及表达研究
研究背景  红细胞的生理功能是通过血红蛋白运输氧和二氧化碳,临床上输注红细胞悬液能改善血流动力学,提高携氧量,维持机体的氧化反应。红细胞在体外储存过程中,细胞代谢、功能以及形态学相继发生改变,称之为储存损伤,英文特别用“...
张怡宇
关键词:红细胞基因测序生物信息学分析
储存血小板差异性长链非编码RNA表达谱研究被引量:7
2018年
目的探讨机采血小板储存过程中差异性lncRNA表达谱变化及其差异表达的lncRNA在血小板储存损伤中潜在的生物学功能。方法收集13(人)份O型健康男性机采血小板各50 m L,于(22±2)℃下震荡储存,应用lncRNA芯片技术检测储存2、5、8 d机采血小板中lncRNA和mRNA表达谱变化;运用GO分析及KEGG分析预测差异表达的lncRNA功能分布,通过顺式调控分析预测lncRNA调控邻近蛋白编码基因表达的分子机制;采用实时PCR(RT-PCR)技术,验证8条lncRNA(MARCH2-2∶1、SLC2A2-1∶1、WBSCR16-3∶6、WEE1-2∶1、ENTPD6-2∶1、NKD2-1∶1、FOXS1-2∶1、MAPK13-3∶1)和4条mRNA(BCL2L1、CAPN2、MAPK14、VAMP8)的表达。结果芯片检测:血小板储存5与2 d相比,有162种lncRNA的表达量发生明显变化,表达升高的4种、降低的158种;8与2 d相比,有691种lncRNA表达量发生明显变化,表达升高的20种、降低的671种;8与5 d相比,246种lncRNA表达量发生明显变化,升高的2种,降低的244种。GO和KEGG分析:差异表达的lncRNA可能参与的生理过程有血小板激活、血小板聚集、内吞、凋亡、肌动蛋白纤维聚集、肌动蛋白骨架的调节;顺式调控分析:lncRNA具有调控血小板相关mRNA表达的功能,USP39-1调控VAMP8的表达、TMEM86B-2调控GP6的表达、FOXS1-2调控BCL2L1的表达等。RT-PCR验证:与芯片检测结果一致,其中lncRNA MARCH2-2∶1、WEE1-2∶1和NKD2-1∶1表达量升高,WBSCR16-3∶6、SLC2A2-1∶1、ENTPD6-2∶1、FOXS1-2∶1和MAPK13-3∶1表达量下降,BCL2L1,CAPN2,MAPK14和VAMP8的表达量也下降。结论血小板中含有大量的lncRNA,其表达量随着血小板储存时间延长而呈不同的变化趋势,总体来讲下调的lncRNA数量较多,且下调的幅度较大。部分变化的lncRNA可能与血小板生理功能密切相关,并且在血小板储存损伤中发挥作用。
李楠苑召虎陈小洁黄建云张怡宇魏亚明
关键词:血小板长链非编码RNA基因芯片生物信息学分析
《特殊紧急抢救输血推荐方案》应用实践被引量:8
2016年
目的分析《特殊情况紧急抢救输血推荐方案》(简称《紧急输血方案》)在医院紧急医疗抢救工作中实施的效果及意义。方法根据《紧急输血方案》的应用范围,从广州市第一人民医院2013-2015年46 061例输血病例中,收集《紧急输血方案》公布前后3年符合特殊情况紧急抢救输血的524例病例做回顾性总结分析和比较,包括《紧急输血方案》实施前后特殊情况紧急抢救输血的一般及变化情况、ABO及Rh血型同型输注与相容性输注比例、输血适应证种类、病例的临床科室分布、实验室检测处理时间以及输血不良反应发生率等。结果在《紧急输血方案》的指导下,完成374例特殊情况需要紧急抢救输血的临床输血病例,医院输血科及相关科室执行紧急特殊输血治疗的能力和时间效率都有很大提高,尤其是《紧急输血方案》公布前后处理ABO疑难血型患者紧急抢救输血病例的实验室处理时间(h)由1.37±0.21缩短至0.32±0.10(P<0.05)、库存不足导致需要不同型血液成分输注的实验室处理时间(h)由0.31±0.10缩短至0.22±0.10(P<0.05),并体现在RhD阴性血患者紧急抢救的病例中。结论《紧急输血方案》为输血科和临床科室提供了科学、规范、标准的输血急救治疗依据和指导,使得抢救输血能有效缓解患者病情和赢得治疗时间。
吴千羽李楠张怡宇陈小洁黄建云魏亚明刘景汉兰炯采
关键词:输血紧急抢救
共1页<1>
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