刘杨安
- 作品数：2 被引量：6H指数：1
- 供职机构：南方医科大学公共卫生与热带医学学院病毒研究所更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金广东省自然科学基金更多>>
- 相关领域：医药卫生更多>>
- 泰国、越南与香港人源H5N1禽流感病毒序列比对及进化特点分析被引量：6
- 2007年
- [目的]禽流感病毒不仅引起禽类感染和流行,而且可以打破种属屏障、引起人或其他哺乳动物感染和传播,欲对1997年香港和2004年泰国、越南直接感染人的H5N1禽流感病毒基因组序列进行比对及进化特点分析。[方法]利用Lasergene软件包中的EditSeq从14株禽流感病毒分离株截取HA、NA、M2基因序列并翻译成氨基酸,然后用ClustalX软件对截取的片断进行比较分析。[结果]①2004年泰国、越南人源H5N1毒株的HA切割位点上的氨基酸序列和1997年香港人源H5N1毒株一致;②2004年泰国、越南人源H5N1毒株和1997年香港人源H5N1毒株具有相同的受体结合位点;③泰国和越南人源H5N1毒株的NA茎部缺失了20个氨基酸而在HA上增加了一个潜在糖基化位点;④M2蛋白某些氨基酸位点发生改变,导致部分泰国和越南人源H5N1毒株对金刚烷胺产生耐药性。[结论]1997年香港和2004年泰国、越南直接感染人的H5N1禽流感病毒基因组序列发生了改变。
- 赖沛龙邹梦晨朱利卢扬柏刘杨安张玲卢翔宇赵卫
- 关键词：HANAM2耐药性
- 中国H5N1禽流感病毒HA基因的分子进化分析
- 2008年
- 为了阐明中国H5N1禽流感病毒血凝素(HA)基因的分子进化规律,从GenBank下载中国近年来分离的27株禽流感H5N1病毒的HA基因,利用LaserGene软件包中的EditSeq程序剪切共同序列并翻译成氨基酸序列,与DNAMAN软件进行比对,并以LaserGene软件包中的MegAlign程序构建分子进化树,结合背景资料分析其传播流行规律。结果显示:①在HA裂解位点上游毗邻的位置,gdch04、gddu04、gxch0405、gxdu05、gxqu0502、hkcph05、stch05、stqu05、ynch0502株都缺失了三个碱基;②27株毒株在HA裂解位点上游毗邻的位置存在多个连续的碱性氨基酸;③来自广西的gxch0405、gxdu05、gxqu0502和来自香港的hkcph05、hkgh04的序列同源性很高,很可能与苍鹭的迁移有关;④来自广西的gxqu0502和来自香港的hkcph05亲源关系很近,很可能来自同一祖先。
- 刘杨安赵卫赖沛龙卢扬柏朱利张玲
- 关键词：H5N1分子进化分析
