何龙霞
- 作品数:5 被引量:3H指数:1
- 供职机构:上海交通大学医学院附属新华医院更多>>
- 相关领域:医药卫生生物学更多>>
- 运用耳聋基因隐性突变携带者重测序策略纠正假阳性变异的致病性误判被引量:1
- 2017年
- 目的·运用隐性突变携带者重测序策略发现并归类耳聋致病基因罕见良性变异,为遗传性耳聋的高通量二代测序结果解读提供良性多态参考数据库。方法·在已明确隐性耳聋基因双等位基因致病突变的耳聋患者的正常听力亲属中进行相应突变筛查,发现单杂合致病突变的携带者。运用靶向捕获二代测序技术在这些携带者中对相应耳聋基因进行外显子重测序,对所发现的对侧等位基因变异进行非致病性推断。结果·共30位正常听力的耳聋病例亲属被明确为某一已知耳聋基因隐性致病突变的杂合携带者。通过相应基因的靶向二代测序,在对侧等位基因上共发现32个非同义变异,在隐性完全外显的遗传模式下可被归类为良性非致病变异。其中SLC26A4基因p.A434T变异、LOXHD1基因p.R266Q变异、MYO15A基因p.K96Q变异、GJB2基因p.T123N变异及CDH23基因p.V1299I变异,共5个罕见变异等位基因频率小于0.005,部分变异被Polyphen-2、PROVEAN、SIFT或Mutation Taster软件预测为致病突变,或被耳聋变异数据库或人类基因组突变数据库记载为致病突变。结论·运用隐性突变携带者重测序策略可有效纠正部分被误判为致病的罕见良性变异,提高二代测序在单基因隐性遗传病病因诊断中的准确性和有效性。
- 施俊何龙霞杨涛
- 关键词:耳聋常染色体隐性遗传携带者
- GJB2和SLC26A4基因部分罕见变异的致病性研究被引量:2
- 2016年
- 目的通过对听力正常的耳聋人群亲属的基因筛查,对隐性遗传性耳聋基因部分罕见错义序列变异的致病性提出一种简单而有效的排查方法。方法收集800例具有不同程度听力障碍患者的DNA样本,通过多聚酶链反应(PCR)扩增GJB2和/或SLC26A4基因片段(包括编码外显子和邻近的侧翼区域),并对PCR产物进行Sanger测序和序列分析。当先证者含有明确致病突变时,在取得同意的情况下进一步对其听力正常的亲属进行相应基因的突变检测。结果在3个携带GJB2或者SLC26A4基因突变的先证者亲属中,一些正常听力者以复合杂合的形式同时携带GJB2或者SLC26A4基因的一个致病性明确突变和一个致病性不明确的罕见序列变异,包括GJB2基因p.T123N/c.235del C突变(2例)和SLC26A4基因p.A434T/c.919-2A>G突变(1例)。结论 GJB2基因p.T123N和SLC26A4基因p.A434T可基本排除为外显率较高的致病性突变的可能性。以上关于隐性遗传性耳聋基因疑似突变致病性的排除方法相对简便易行,通过大样本量的基因筛查可以为临床遗传性耳聋基因诊断和遗传咨询提供更可靠、明确的依据。
- 何龙霞王晓雯朱亚忠吴皓杨涛
- 关键词:耳聋GJB2SLC26A4
- POU4F3基因突变在中国汉族人群中导致非综合征型耳聋的研究
- 目的 POU4F3基因是常染色体显性遗传性耳聋基因,其分子结构已有较深入的研究,但是其与遗传性耳聋相关的致病突变却不多,尤其在中国人群中,尚未见到相关的文献报道。因此,本研究对POU4F3基因突变在中国汉族人群中导致非综...
- 何龙霞杨涛
- 关键词:耳聋突变
- KARS基因点突变小鼠模型的构建方法及其应用
- 本发明提供KARS基因点突变小鼠模型的构建方法及其应用,KARS基因点突变小鼠模型的构建方法包括如下步骤:步骤一:靶点构建,寻找与神经系统疾病相应的基因,并进行靶点设计;步骤二:设计Guide‑RNA/Cas9mRNA,...
- 汪锡金杨涛余力加何龙霞宋珺王西樵
- 文献传递
- KARS基因点突变小鼠模型的构建方法及其应用
- 本发明提供KARS基因点突变小鼠模型的构建方法及其应用,KARS基因点突变小鼠模型的构建方法包括如下步骤:步骤一:靶点构建,寻找与神经系统疾病相应的基因,并进行靶点设计;步骤二:设计Guide‑RNA/Cas9mRNA,...
- 汪锡金杨涛余力加何龙霞宋珺王西樵