李秋兰
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
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- RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因预测及其生物信息学分析
- 目的: RYBP是PcG蛋白依赖的转录抑制因子,通过一系列表观遗传学机制参与细胞的增殖与分化和肿瘤的发生发展等多种生理和病理过程.我们前期研究发现RYBP在白血病细胞中高表达并介导白血病细胞凋亡,可以增加化疗敏感性,但...
- 李秋兰
- 关键词：白血病转录抑制因子细胞凋亡生物信息学
- RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因预测被引量：1
- 2017年
- 目的探讨RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因。方法利用慢病毒介导的RNA干扰技术,建立多批次RYBP基因稳定沉默的HL60细胞株及空载体对照组(NC);通过二代测序技术对不同批次干扰的上述3对细胞进行mRNA测序及miRNA测序,利用KEGG等生物信息学分析方法 ,预测靶基因。结果成功构建RYBP稳定沉默的HL60细胞株。二代测序筛选出明显差异的mRNA及miRNA(P<0.05)。Pathway显著性富集分析发现表达下调的基因与氨基酸合成,癌症转录调节紊乱,氨基酸代谢等相关的KEGG pathway有关,详见后述;沉默RYBP后,SPI1与hsa-miR-214-3p均表达降低(P<0.05)。结论RYBP介导白血病细胞凋亡的靶基因可能为:BBC3、BAI1、SESN2、CCNG2、JAK3、STAT4、SPI1、BCL6、CD11b和hsa-miR-214-3p。
- 李秋兰王顺清张玉平陈晓燕谢健晋吴亮亮
- 关键词：白血病靶基因
