曹振龙
- 作品数：5 被引量：6H指数：2
- 供职机构：河北大学生命科学学院更多>>
- 发文基金：河北省自然科学基金国家自然科学基金上海市科学技术委员会资助项目更多>>
- 相关领域：生物学化学工程农业科学更多>>
- 鲫鱼GABAARβ_3亚基生物信息学分析与同源建模被引量：1
- 2014年
- A型γ-氨基丁酸（aminobutyric acid，GABA）是一类配体门控离子通道型受体，亦为脊椎动物和非脊椎动物的中枢神经系统内最主要的抑制性神经递质GABA的受体，其离子通道上存在氟虫腈等杀虫剂的作用靶点，是医药和农药工作者研究的重点。通过RACE—PCR技术成功获取新基因鲫鱼GABAARβ3的全长（GenBank登录号：KC964110）。序列分析显示该基因核苷酸序列共2767bp，含有1个由502个氨基酸残基组成的开放阅读框，编码蛋白分子量约为56KD。报道了该基因的生物信息学分析和三维结构模拟及其与氟虫腈作用情况，BLAST结果表明，氨基酸序列与其他已知GABAAR岛基因家族成员间序列相似性介于76％～89％之间，并与其他亚族蛋白基因存在很高的同源性。以线虫体内对阿维菌素敏感的谷氨酸门控氯离子通道受体蛋白的a亚基（PDBID：3RHW）作为模板，用DS（Discovery Studio）模拟鲫鱼GABAA鼠亚基的同源五聚体结构，优化结构模型，与农药配体分子做分子对接，计算作用模式和结合能力。研究鱼类GABAAR亚基与农药分子的作用。
- 秦菠张博周艳芬汪小芬曹振龙任天瑞王振山
- 关键词：鲫鱼污染克隆
- 鲫鱼γ-氨基丁酸受体β_3亚基基因克隆及其分析
- 2014年
- γ-氨基丁酸受体(GABAR)主要存在于脊椎动物和非脊椎动物的中枢神经系统(CNS),是氟虫腈、阿维菌素、硫丹和林丹等杀虫剂的作用靶标。为了阐明GABAR拮抗剂类农药影响鱼类安全性的分子作用机理,并研究其与农药分子的亲和作用,运用生物信息学方法,在NCBI基因组数据库中找到已经公布的同源的GABAARβ3亚基基因序列,通过多序列同源比对寻找高度保守区,再根据高度保守区设计特异性引物,通过RT PCR和RACE PCR技术,成功地克隆了鲫鱼GABAR A型β3亚基基因的全长cDNA序列(GenBank登录号:KC964110),该基因长2 767 bp,开放阅读框(ORF)为1 506 bp,编码502个氨基酸,与已知的其他物种β3亚基具有高度的保守性。应用qRT-PCR扩增,检测到该基因在鲫鱼不同组织器官的差异性表达。
- 秦菠张博周艳芬汪小芬曹振龙任天瑞王振山
- 关键词：鲫鱼Γ-氨基丁酸基因克隆
- 利用SSH方法筛选与鉴定AC3基因缺失小鼠主要嗅觉表皮内的差异表达基因被引量：3
- 2014年
- 腺苷酸环化酶3(Adenylate cyclase 3,AC3)基因在小鼠主要嗅觉表皮(Main olfactory epithelium,MOE)内的嗅觉信号传导中起着重要作用,AC3缺失是否会导致MOE内与之相关的基因发生差异表达,尚待确定。文章利用抑制性消减杂交(Suppression subtractive hybridization,SSH)方法,以AC3敲除(AC3-/-)及其同窝出生的野生型(AC3+/+)小鼠MOE为材料,构建了正向和反向两个消减文库,采用斑点杂交对消减文库进行初步筛选,对筛选出的差异表达基因进行序列测定及生物信息学分析,并利用荧光定量PCR(qRT-PCR)方法对其进行验证。斑点杂交筛选获得了386个差异表达克隆,随机选取其中的80个进行DNA序列测定,经序列比对后发现有62个在GenBank上获得了与之相匹配的基因信息,其中24个上调差异表达克隆对应于kcnk3、mapk7、megf11等基因,38个下调差异表达克隆对应于tmem88b、c-mip、skp1a、mlycd等基因。利用Gene Ontology(GO)方法对这些差异表达基因进行蛋白功能注释,发现它们主要集中在分子结合、细胞周期、生物和细胞过程等功能方面。选取其中上调基因kcnk3和下调基因c-mip、mlycd、tmem88b及trappc5进行qRT-PCR验证。结果表明,在AC3-/-小鼠MOE内kcnk3的表达量显著上调,是对照组小鼠的1.27倍,而c-mip、mlycd、tmem88b和trappc5的表达量显著下调,为对照组小鼠的20%、7%、32%和29%。这些基因的功能与K+通道、细胞发育与分化、脂肪代谢和膜蛋白转运等密切相关。推测它们可能与AC3基因共同作用,调节小鼠MOE内的嗅觉信号传导信息。
- 曹振龙郝江叶周艳芬张喆倪志华胡远想刘伟丽李永超Daniel R.Storm马润林王振山
- 关键词：差异表达基因抑制性消减杂交
- 利用SSH技术筛选与鉴定小鼠MOE内受AC3调控的差异表达基因
- 在哺乳动物中,嗅觉功能的行使依赖两个主要功能器官,即主要嗅觉表皮(MOE)和犁鼻器(VNO),研究表明MOE内嗅觉信号转导过程是由cAMP信号通路介导的。小鼠MOE内cAMP信号通路的主要成分包括嗅觉受体、Golf蛋白、...
- 曹振龙
- 关键词：抑制性消减杂交技术差异表达基因
- 文献传递
- 腺苷酸环化酶Ⅲ(AC3)在非神经细胞内的定位（英文）被引量：2
- 2015年
- 腺苷酸环化酶III(adenylate cyclase III,AC3)最早发现于小鼠主要嗅觉表皮,是c AMP信号通路的组成成分之一,它的缺失可导致小鼠嗅觉丧失、体重增加、雄性不育、母性关爱行为丧失和学习与记忆能力下降等。脊椎动物体内绝大多数细胞具有纤毛,在小鼠大脑神经元中AC3定位于初级纤毛,许多非神经类型细胞也有AC3的表达,然而其与非神经类细胞纤毛的关系尚待确定。该文选择了8种细胞株(2种神经类细胞株、6种非神经类细胞株),对上述问题进行了研究。RT-PCR及其产物DNA测序结果显示,这些细胞中均有AC3的表达。免疫荧光染色结果显示,在IMCD3、293T和BMSCs等细胞株中,AC3与细胞初级纤毛的荧光信号重叠;在A549和He La两种癌细胞株中,AC3也定位在初级纤毛上。该研究结果表明,AC3在多数非神经细胞中也表达于纤毛部位。
- 郝江叶韩绍芳罗影涛杨栋李超张曹振龙胡远想刘伟丽倪志华周艳芬王振山
- 关键词：腺苷酸环化酶免疫荧光染色癌细胞
