陈晓
- 作品数：2 被引量：1H指数：1
- 供职机构：中山大学生命科学学院基因工程教育部重点实验室更多>>
- 发文基金：国家自然科学基金更多>>
- 相关领域：生物学更多>>
- 粟酒裂殖酵母中3个新的box H/ACA snoRNA的鉴定及意义被引量：1
- 2003年
- 真核生物rRNA和snRNA中特定位点的假尿嘧啶化修饰是由box H/ACA snoRNA指导的,这些RNA通常具有保守的H和ACA元件以及“发夹-铰链-发夹-尾”的二级结构。通过筛选cDNA文库,从粟酒裂殖酵母(Schizosaccharomyces pombe)中鉴定了3个新的box H/ACA snoRNA,分别命名为SP12,SP16和SP20。这些小分子RNA 3’末端都具有ACA类元件,其二级结构中包含2或3个较大的类似发夹的结构。尽管SP20的H元件并不典型,但能折叠成典型box H/ACA snoRNA的二级结构,推测其具有指导18S rRNA上U1208和U1053两个位点的假尿嘧啶化修饰的功能。相反,SP12和SP16的二级结构不同于SP20,并且也没有与rRNA或snRNA互补的反义元件,所以被称为“功能未知的向导snoRNA(orphanguide RNA”,其功能尚有待阐明。SP12和SP16的基因都位于2个编码蛋白质基因的间隔区,SP16snoRNA是从一个较大的RNA前体剪切加工而来。有趣的是,SP20基因位于一个预测的蛋白质基因的编码区中,但转录方向相反。Northern杂交和RT-PCR分析都无法检测到该蛋白质基因的mRNA,表明该基因在细胞中的表达是不存在的。这是粟酒裂殖酵母中一个推测编码蛋白质的基因位点反向编码一个小分子RNA的首次报道。
- 瞿国胜周惠于传贺陈晓屈良鹄
- 关键词：粟酒裂殖酵母基因鉴定基因组测序
- 植物RNA组学:box C/D snoRNA的结构与功能进化
- 我们根据snoRNA的结构和生物学特点建立了一种RNA基因识别的生物信息学方法和研究平台,大大提高了分析效率和扩大了分析范围,能够及时地对国际数据库中最新数据进行跟踪分析,具有明显的优越性。采用上述方法系统地分析水稻、拟...
- 陈春龙梁丹周惠卓敏张鹏陈晓陈月琴屈良鹄
- 文献传递
