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李思德
作品数:
1
被引量:6
H指数:1
供职机构:
四川农业大学动物科技学院
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发文基金:
四川省应用基础研究计划项目
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相关领域:
农业科学
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合作作者
吴启超
四川农业大学动物科技学院
张涛
四川农业大学动物科技学院
罗俊
四川农业大学动物科技学院
张军
四川农业大学动物科技学院
何桦
四川农业大学动物科技学院
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李思德
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畜牧兽医学报
年份
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2017
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四川麻鸭mtDNA全序列的克隆和生物信息学分析
被引量:6
2017年
本研究旨在获得四川麻鸭线粒体DNA基因组全序列(mtDNA),为该遗传资源的保护与利用提供参考。研究参照近缘物种线粒体基因组序列,用Primer 6.0设计引物16对,采用PCR克隆测序技术获得四川麻鸭mtDNA基因组序列。结果表明,四川麻鸭mtDNA基因组全长16 604bp,碱基组成为A(29.19%)、C(32.82%)、G(15.79%)、T(22.20%),包含22个tRNA基因、2个rRNA基因、13个蛋白质编码基因和1个非编码控制区(Dloop区)。使用在线软件tRNAscan-SE1.21和RNA structure5.6分析发现,22个tRNA基因是标准的4个恒定臂的三叶草二级结构。对四川麻鸭mtDNA基因组D-loop区序列分析发现含有Poly(c)、TAS、E-box、F-box、D-box、Bird-similarity box及CXB1保守框。用MEGA6.0,采用N-J法基于线粒体D-loop区和全序列做进化树,发现四川麻鸭与隆盛鸭血缘关系最近。
谢艾轩
吴启超
李思德
罗俊
张涛
刘贺贺
张军
何桦
关键词:
线粒体基因组
遗传进化
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