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董世武

作品数：10 被引量：37H指数：3
供职机构：中国农业科学院特产研究所更多>>
相关领域：农业科学生物学更多>>

合作作者

文献类型

  • 10篇中文期刊文章

领域

  • 8篇农业科学
  • 2篇生物学

主题

  • 4篇梅花鹿
  • 3篇动物
  • 3篇染色
  • 3篇染色体
  • 3篇鹿科
  • 3篇鹿科动物
  • 3篇马鹿
  • 3篇基因
  • 2篇鹿茸
  • 2篇母系
  • 2篇母系起源
  • 2篇基因组
  • 2篇Y染色体
  • 1篇蛋白
  • 1篇蛋白质
  • 1篇蛋白质组
  • 1篇蛋白质组学
  • 1篇蛋白质组学分...
  • 1篇电泳
  • 1篇驯鹿

机构

  • 10篇中国农业科学...
  • 1篇东北林业大学
  • 1篇吉林农业大学

作者

  • 10篇邢秀梅
  • 10篇董世武
  • 6篇王磊
  • 6篇张然然
  • 5篇刘华淼
  • 4篇周永娜
  • 3篇鞠妍
  • 1篇陈旭
  • 1篇王洪亮
  • 1篇苏伟林
  • 1篇刘汇涛
  • 1篇刘艳环

传媒

  • 5篇特产研究
  • 3篇畜牧兽医学报
  • 1篇经济动物学报
  • 1篇中国畜牧兽医

年份

  • 1篇2024
  • 1篇2022
  • 2篇2020
  • 2篇2019
  • 2篇2018
  • 2篇2017
共 10 条 记 录，以下是 1-10
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排序方式：
基于GBS技术对梅花鹿、马鹿及其杂交后代基因组SNP特征的分析被引量：10
2019年
旨在利用基因分型测序(genotyping by sequencing,GBS)技术对梅花鹿、马鹿及其杂交后代(F1、F2)基因组的SNP特征进行分析。本试验采用GBS技术对梅花鹿(63个)、马鹿(12个)及其杂交后代(F1代112个,F2代38个,未知类型个体1个)共226个个体的血液基因组DNA进行测序,并利用本实验室前期110只梅花鹿、197只马鹿和1只F1代杂交鹿的测序数据,以梅花鹿全基因组为参考序列进行比对分析。结果,226个个体共产生Clean data 322.683 Gb,平均每个样品1427.802 Mb;将所有样本作为一个群体检测SNP变异,共检测出SNP位点23943582个,质控过滤后得到SNP位点31630个。对31630个SNPs使用最大似然(maximum likelihood,ML)法构建的分子进化树显示,梅花鹿、马鹿、F1及F2代区分明显。对梅花鹿和马鹿的SNPs进行比对分析,筛选出可用于鉴别马鹿、梅花鹿、F1、F2的物种特异SNP位点1032个(马鹿特异SNP位点474个,梅花鹿特异SNP位点558个),计算结果显示,F1代个体包含马鹿特异SNPs的比例主要在40%~60%之间,F2代个体含马鹿特异SNPs的比例主要在10%~30%之间,马鹿个体中不含梅花鹿的特异SNPs,梅花鹿中55.49%的个体不含马鹿特异SNPs,17.34%的个体含马鹿特异SNPs的比例低于1%,13.29%的个体含马鹿特异SNPs的比例在1%~10%之间,其余个体含马鹿特异SNPs的比例为10%~20%(其中有一个个体含马鹿特异SNPs的比例为33.3%)。该研究为花马杂交鹿后代的鉴定提供了可靠标记,并定量估计了F1和F2代个体含马鹿特异SNPs的比例,马鹿个体中不含梅花鹿的特异SNPs,这对梅花鹿、马鹿及其杂交后代(F1、F2)的鉴别具有重要意义。
董世武王天骄刘华淼王磊唐丽昕邢秀梅
关键词：GBS梅花鹿马鹿SNP
鹿科动物染色体研究进展被引量：2
2020年
在细胞遗传学中,染色体的研究是很重要的一部分。在通过查阅相关文献后,本文对近年来鹿科动物染色体的相关研究方法,包括核型、显带分析以及荧光原位杂交等其他技术进行了概述,并指出应该在此基础上拓展新的、更具意义的研究领域。
唐丽昕张然然董世武邢秀梅
关键词：鹿科动物染色体核型显带
基于高通量测序技术的敖鲁古雅驯鹿鹿茸转录组分析被引量：2
2020年
试验旨在通过高通量测序技术获得驯鹿的遗传信息和鹿茸组织的转录组特征,并进一步挖掘其中与鹿茸经济性状相关的关键基因信息。对驯鹿鹿茸组织提取RNA,检测RNA纯度、完整性及是否有污染,合格后构建文库,文库构建成功需要进行库检,库检合格后使用Illuminanovaseq平台进行转录组测序分析。利用Diamond、HMMER、KAAS、Blast2GO等软件对驯鹿鹿茸转录组序列进行了功能注释、基因丰度分析和其他分析。结果显示,测序获得47818202条raw reads,经过滤和质量检查得到了46964478条clean reads,组装后得到49171个Unigenes,表明本次测序获得了高质量的鹿茸转录组。基于序列一致性分析,Unigenes与NR、Swiss-Prot、KOG、KEGG、Pfam、GO数据库比对注释成功总共占89.54%,共44029条序列。Corset聚类后得到49171个Unigenes,在这些Unigenes中共找到13795个SNPs位点和18446个SSRs位点。GO注释结果显示22955个Unigenes得到注释,占总注释结果的46.68%。与KEGG数据库进行比对分析,发现49171个Unigenes可能参与或涉及代谢途径,其中20258个Unigenes共注释到32个KEGG代谢通路。此外,在转录组结果中发现了一些高丰度的基因,如OPN、TMSB4、TMSB10等,它们的功能可能与驯鹿生茸有关。本试验结果不仅对驯鹿的基因组数据进行了补充,而且还初步揭示了生长期驯鹿鹿茸的基因特征,为驯鹿分子遗传学研究、资源保护与利用及种群资源恢复提供了参考。
鞠妍刘华淼何金明王磊赵佩张然然董依萌董世武唐丽昕邢秀梅
关键词：驯鹿鹿茸高通量测序转录组
鹿产品鉴别的研究进展被引量：7
2018年
鹿产品是名贵中药材,亦可作为保健品,价格昂贵。目前市场上出现了许多杂交鹿的产品,还有其他以次充好、以假乱真的现象,不仅严重扰乱了市场秩序,侵犯了消费者的权益,同时也阻碍了中国鹿业的健康发展,因此鹿产品的鉴别变得非常重要。从历年来有关鹿产品鉴别的报道来看,现有的鉴别方法大致可分为性状鉴别、显微鉴别、理化鉴别和分子鉴别4种。本文对相关的报道作了汇总,为后续鹿产品鉴别的研究提供参考。
董世武王磊周永娜邢秀梅
关键词：梅花鹿马鹿鹿产品
马鹿鹿茸不同部位差异蛋白质组学分析被引量：5
2017年
旨在从差异蛋白质组学角度为鹿茸生物学特性的阐明奠定理论基础。本研究以天山马鹿65和75d鹿茸不同部位为试验材料,通过双向凝胶电泳、MALDI-TOF-MS质谱鉴定技术,结合生物信息学分析,成功鉴定出65种差异蛋白质,涉及代谢过程、细胞过程、发育过程、定位以及应激等生物学过程,还参与了血小板活化、黏着斑、代谢通路、PI3K-Akt信号通路等代谢通路。这些蛋白包括骨发育相关蛋白4种、神经发育相关蛋白3种、血管发育相关蛋白2种、抗氧化、内质网应激相关蛋白4种、免疫相关蛋白7种、凋亡相关蛋白5种。结果显示,TTR、RBP4、CRABP1在由65d鹿茸过渡到75d鹿茸的过程中,对鹿茸生长发育起一定调控作用。PRDX2、TXNDC5、ERP29、Pdia6在内质网应激、抗氧化中起重要作用。内质网应激、内质网相关性死亡途径、线粒体凋亡途径可在一定程度上阐明鹿茸细胞快速增殖分化的同时存在大量细胞凋亡现象,以满足快速生长、发育的需要。另外,GMFβ、CATHL1两种蛋白在神经发育和炎症抗性中可能具有重要的作用。
王磊张然然刘华淼刘汇涛周永娜董世武邢秀梅
关键词：天山马鹿鹿茸蛋白质组学双向凝胶电泳
牛、羊和鹿科动物遗传多样性及起源研究进展
2024年
牛、羊和鹿资源是人类的宝贵财富,不仅能够为人类提供丰富的肉奶等产品,而且在医药、科学研究等方面有着无可替代的价值,但这些遗传资源正在丢失并且部分品种已经濒危甚至灭绝。探究其遗传多样性和起源可全面的了解群体现状、遗传变异和分化以及明确祖先类型和迁徙路线,并提出科学的保种选育方案,为遗传资源保护提供科学依据。本文综述了牛、羊和鹿科动物的遗传多样性的研究方法以及父系、母系起源的研究进展,为保护种质资源和濒危物种以及遗传资源的开发利用提供参考依据。
杨苏坤陈旭唐丽昕董世武王洪亮邢秀梅
关键词：母系起源
牛、羊、马及鹿科动物母系起源和父系起源研究进展被引量：3
2017年
线粒体DNA和Y染色体是哺乳动物母系起源和父系起源的重要分子遗传标记。哺乳动物线粒体DNA在母系起源中的研究主要集中在Cytb基因、D-Loop区、12Sr RNA和16Sr RNA,而利用线粒体DNA全序列进行起源进化的研究则相对较少。Y染色体在父系起源中的研究主要围绕在Y染色体多态性研究、Y染色体微卫星研究、Y染色体基因拷贝数3各方面。本文就近年来线粒体DNA和Y染色体在母系起源、父系起源中的研究现状进行综述,为哺乳动物起源进化的研究提供理论依据。
周永娜刘华淼鞠妍张然然王磊董世武邢秀梅刘艳环
关键词：母系起源Y染色体
梅花鹿基因组微卫星分布特征研究被引量：3
2022年
为深入研究梅花鹿基因组中微卫星结构和特征,开发梅花鹿专用微卫星标记,本研究利用课题组前期测序、拼接和组装得到的梅花鹿基因组序列,搜索并分析了微卫星分布特征。在梅花鹿基因组中1~6 bp碱基微卫星有354766个,总长度为7696656 bp,相对密度为3229.89 bp/Mb,约占基因组总长度的0.31%。不同类型微卫星拷贝数量占比和大小分别为二碱基(80.33%)>三碱基(9.86%)>五碱基(4.25%)>四碱基(3.64%)>单碱基(1.58%)>六碱基(0.32%)。1~6 bp不同碱基类型微卫星的优势类别分别为A、TG、AGC、AAAT、ACTGA和TTCACT。将微卫星定位到了33条染色体上,分布频率最高的是X染色体,其次是30号染色体,最低的是7号染色体,梅花鹿33条染色体序列长度与所含微卫星数量呈正相关(r=0.99,P<0.0001)。梅花鹿基因组中16 bp碱基微卫星数量丰富,能够筛选出足够的微卫星标记,用于梅花鹿亲子鉴定、个体识别技术。
卢凯妹王天骄董世武邢秀梅苏伟林
关键词：梅花鹿基因组微卫星
基于PCR技术的鹿源性产品成分分子检测研究进展被引量：3
2019年
鹿产品多种多样且价格昂贵,其中仅鹿科动物梅花鹿和马鹿的产品被视为正品。由于产品加工过程中其形态结构及理化性质均有不同程度的改变,传统方法难以对产品成分进行准确的定性分析,而分子检测技术反应灵敏、准确性高,被越来越多地应用于鹿源性产品成分的检测中。本文基于mtDNA、SRY基因、microsatellite DNA和SNP在分子检测中的应用,对近年来鹿源性产品成分的分子检测方法进行了综述,以期为后续鹿源性产品成分的分子检测研究提供参考。
董世武王天娇张然然唐丽昕邢秀梅
关键词：分子检测线粒体DNA细胞色素B
利用Y染色体基因分析梅花鹿种公鹿的遗传多样性和父系起源被引量：3
2018年
旨在利用Y染色体基因研究梅花鹿种公鹿的遗传多样性和父系起源,为梅花鹿的保种育种工作提供数据支持。对171只双阳、敖东、四平、东丰、兴凯湖、长白山和东大梅花鹿种公鹿Y染色体上的AMELY、DBY、USP9Y、SRY基因的5个片段进行PCR扩增,对PCR产物进行直接测序和生物信息学分析。结果表明,5个基因片段共筛选到8个突变位点,AMELY1、AMELY2、DBY、USP9Y、SRY基因片段分别有3、2、1、1、1个突变位点。利用DNASP5.1软件共定义了10种单倍型,分别为H1、H2、H3、H4、H5、H6、H7、H8、H9、H10,其中H1是优势单倍型,占梅花鹿种公鹿群体的49.1%,H5和H10为东丰梅花鹿种公鹿独有,H9是最原始的单倍型。171只梅花鹿种公鹿的单倍型多样性为0.696 80,核苷酸多样性为0.000 36。NJ系统进化树和structure群体结构分析结果表明,梅花鹿种公鹿有3个父系类型,分别为Y1、Y2和Y3,除双阳梅花鹿种公鹿和四平梅花鹿种公鹿均来自Y3,其余梅花鹿种公鹿群体均为多父系类型。表明我国梅花鹿种公鹿Y染色体具有较高的单倍型多样性和极低的核苷酸多样性。
周永娜刘华淼鞠妍张然然王磊董世武邢秀梅
关键词：Y染色体
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