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杨媛

作品数：1 被引量：4H指数：1
供职机构：武汉大学中南医院更多>>
发文基金：湖北省自然科学基金更多>>
相关领域：医药卫生更多>>

合作作者

文献类型

  • 1篇中文期刊文章

领域

  • 1篇医药卫生

主题

  • 1篇炎症
  • 1篇炎症性
  • 1篇炎症性肠病
  • 1篇英夫利昔单抗
  • 1篇治疗疗效
  • 1篇生物信息
  • 1篇生物信息学
  • 1篇相关基因
  • 1篇疗效
  • 1篇基因
  • 1篇肠病

机构

  • 1篇武汉大学
  • 1篇通城县人民医...

作者

  • 1篇王昕
  • 1篇陈志芬
  • 1篇孙萌
  • 1篇杨媛
  • 1篇张瑜
  • 1篇胡玲珍

传媒

  • 1篇中华实验外科...

年份

  • 1篇2017
共 1 条 记 录，以下是 1-1
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排序方式：
炎症性肠病患者英夫利昔单抗治疗疗效相关基因的筛选被引量：4
2017年
目的 探讨炎症性肠病（IBD）患者英夫利昔单抗（IFX）治疗疗效相关关键基因。 方法 通过生物信息学方法，利用GEO数据库中接受IFX首次治疗的溃疡性结肠炎（UC）、结肠型克罗恩病（CDc）患者治疗前结肠黏膜基因芯片数据，基因集富集分析（GSEA）初步筛选出UC和CDc结肠黏膜中在共富集的基因本体（GO）功能集上的基因，在此基础上运用STRING在线数据库绘制基因相互作用网络图，通过Cytoscape软件筛选出网络中心节点及与其直接关联且相互作用关系≥3的基因，最后通过STRING数据库对这些基因进行京都基因与基因组百科全书通路（KEGG通路）分析，寻找相关信号通路和基因间的相互作用，以探讨其影响IFX疗效的分子机制。结果 通过GSEA分析出IFX无效的UC和CDc患者结肠黏膜中70个上调的基因在GO功能基因集＂蛋白质代谢过程的正调控＂上共富集[错误发现率（FDR）〈25%]；这些基因在STRING数据库中绘制的网络关联图通过Cytoscape软件分析得到相互作用关系最多的基因为白细胞介素（IL）-6相关基因，以其为中心节点筛选出17个直接关联并且相互作用关系≥3的基因，这些基因主要涉及的信号通路为：Toll样受体信号通路、Janus酪氨酸激酶（JAK）-信号转导与转录激活因子（STAT）信号通路、细胞因子受体相互作用，均参与炎症形成。IL-6在以上3条主要促炎通路中均起作用。结论 UC和CDc患者结肠黏膜IL-6基因表达水平与IFX疗效相关，它可通过多种途径发挥促炎作用。
杨媛张瑜胡玲珍孙萌杨张朔习一清徐利华潘雪凯谢伟王昕陈志芬
关键词：炎症性肠病疗效基因生物信息学
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